Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
YTHDC1Q96MU7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
YTHDC1Q96MU7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
YTHDC1Q96MU7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
YTHDC1Q96MU7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
YTHDC1Q96MU7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
YTHDC1Q96MU7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
YTHDC1Q96MU7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
YTHDC1Q96MU7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
YTHDC1Q96MU7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
YTHDC1Q96MU7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
YTHDC1Q96MU7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
YTHDC1Q96MU7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
YTHDC1Q96MU7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
YTHDC1Q96MU7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
YTHDC1Q96MU7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
YTHDC1Q96MU7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
YTHDC1Q96MU7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
YTHDC1Q96MU7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
YTHDC1Q96MU7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
YTHDC1Q96MU7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
YTHDC1Q96MU7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
YTHDC1Q96MU7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
YTHDC1Q96MU7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
YTHDC1Q96MU7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
YTHDC1Q96MU7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
YTHDC1Q96MU7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
YTHDC1Q96MU7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
YTHDC1Q96MU7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
YTHDC1Q96MU7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
YTHDC1Q96MU7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
YTHDC1Q96MU7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
YTHDC1Q96MU7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
YTHDC1Q96MU7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
YTHDC1Q96MU7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
YTHDC1Q96MU7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
YTHDC1Q96MU7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
YTHDC1Q96MU7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
YTHDC1Q96MU7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
YTHDC1Q96MU7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
YTHDC1Q96MU7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
YTHDC1Q96MU7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
YTHDC1Q96MU7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
YTHDC1Q96MU7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
YTHDC1Q96MU7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
YTHDC1Q96MU7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
YTHDC1Q96MU7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
YTHDC1Q96MU7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
YTHDC1Q96MU7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
YTHDC1Q96MU7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
YTHDC1Q96MU7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
YTHDC1Q96MU7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
YTHDC1Q96MU7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
YTHDC1Q96MU7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
YTHDC1Q96MU7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
YTHDC1Q96MU7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
YTHDC1Q96MU7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
YTHDC1Q96MU7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
YTHDC1Q96MU7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
YTHDC1Q96MU7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
YTHDC1Q96MU7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
YTHDC1Q96MU7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
YTHDC1Q96MU7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
YTHDC1Q96MU7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
YTHDC1Q96MU7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
YTHDC1Q96MU7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
YTHDC1Q96MU7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
YTHDC1Q96MU7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
YTHDC1Q96MU7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
YTHDC1Q96MU7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
YTHDC1Q96MU7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
YTHDC1Q96MU7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
YTHDC1Q96MU7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
YTHDC1Q96MU7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
YTHDC1Q96MU7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
YTHDC1Q96MU7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
YTHDC1Q96MU7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
YTHDC1Q96MU7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
YTHDC1Q96MU7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
YTHDC1Q96MU7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
YTHDC1Q96MU7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
YTHDC1Q96MU7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
YTHDC1Q96MU7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
YTHDC1Q96MU7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
YTHDC1Q96MU7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
YTHDC1Q96MU7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
YTHDC1Q96MU7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
YTHDC1Q96MU7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
YTHDC1Q96MU7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
YTHDC1Q96MU7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
YTHDC1Q96MU7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
YTHDC1Q96MU7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
YTHDC1Q96MU7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
YTHDC1Q96MU7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
YTHDC1Q96MU7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
YTHDC1Q96MU7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
YTHDC1Q96MU7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
YTHDC1Q96MU7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
YTHDC1Q96MU7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
YTHDC1Q96MU7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms