Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRIM47Q96LD4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRIM47Q96LD4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRIM47Q96LD4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRIM47Q96LD4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRIM47Q96LD4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRIM47Q96LD4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRIM47Q96LD4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRIM47Q96LD4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRIM47Q96LD4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRIM47Q96LD4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRIM47Q96LD4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRIM47Q96LD4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRIM47Q96LD4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRIM47Q96LD4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRIM47Q96LD4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRIM47Q96LD4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRIM47Q96LD4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRIM47Q96LD4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRIM47Q96LD4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRIM47Q96LD4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRIM47Q96LD4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRIM47Q96LD4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRIM47Q96LD4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRIM47Q96LD4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRIM47Q96LD4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRIM47Q96LD4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRIM47Q96LD4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRIM47Q96LD4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TRIM47Q96LD4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRIM47Q96LD4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRIM47Q96LD4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TRIM47Q96LD4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRIM47Q96LD4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRIM47Q96LD4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRIM47Q96LD4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRIM47Q96LD4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRIM47Q96LD4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRIM47Q96LD4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TRIM47Q96LD4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRIM47Q96LD4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRIM47Q96LD4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TRIM47Q96LD4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIM47Q96LD4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIM47Q96LD4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIM47Q96LD4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIM47Q96LD4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIM47Q96LD4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIM47Q96LD4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIM47Q96LD4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIM47Q96LD4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TRIM47Q96LD4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRIM47Q96LD4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRIM47Q96LD4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRIM47Q96LD4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRIM47Q96LD4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TRIM47Q96LD4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRIM47Q96LD4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRIM47Q96LD4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRIM47Q96LD4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRIM47Q96LD4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRIM47Q96LD4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRIM47Q96LD4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRIM47Q96LD4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM47Q96LD4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM47Q96LD4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM47Q96LD4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TRIM47Q96LD4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TRIM47Q96LD4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRIM47Q96LD4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM47Q96LD4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRIM47Q96LD4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
TRIM47Q96LD4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRIM47Q96LD4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRIM47Q96LD4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRIM47Q96LD4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRIM47Q96LD4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRIM47Q96LD4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRIM47Q96LD4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRIM47Q96LD4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM47Q96LD4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM47Q96LD4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM47Q96LD4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRIM47Q96LD4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRIM47Q96LD4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM47Q96LD4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM47Q96LD4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM47Q96LD4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM47Q96LD4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIM47Q96LD4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIM47Q96LD4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms