Protein–RNA interactions for Protein: Q96L12

CALR3, Calreticulin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALR3Q96L12 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALR3Q96L12 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALR3Q96L12 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CALR3Q96L12 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CALR3Q96L12 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CALR3Q96L12 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CALR3Q96L12 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CALR3Q96L12 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALR3Q96L12 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALR3Q96L12 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CALR3Q96L12 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CALR3Q96L12 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALR3Q96L12 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALR3Q96L12 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALR3Q96L12 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALR3Q96L12 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALR3Q96L12 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALR3Q96L12 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALR3Q96L12 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALR3Q96L12 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CALR3Q96L12 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CALR3Q96L12 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CALR3Q96L12 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CALR3Q96L12 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CALR3Q96L12 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALR3Q96L12 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CALR3Q96L12 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CALR3Q96L12 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CALR3Q96L12 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CALR3Q96L12 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CALR3Q96L12 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CALR3Q96L12 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CALR3Q96L12 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CALR3Q96L12 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CALR3Q96L12 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CALR3Q96L12 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALR3Q96L12 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CALR3Q96L12 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CALR3Q96L12 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CALR3Q96L12 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CALR3Q96L12 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CALR3Q96L12 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALR3Q96L12 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALR3Q96L12 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALR3Q96L12 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALR3Q96L12 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALR3Q96L12 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALR3Q96L12 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALR3Q96L12 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALR3Q96L12 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALR3Q96L12 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALR3Q96L12 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALR3Q96L12 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALR3Q96L12 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALR3Q96L12 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CALR3Q96L12 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALR3Q96L12 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALR3Q96L12 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALR3Q96L12 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALR3Q96L12 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALR3Q96L12 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALR3Q96L12 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALR3Q96L12 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALR3Q96L12 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALR3Q96L12 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALR3Q96L12 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALR3Q96L12 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALR3Q96L12 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALR3Q96L12 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CALR3Q96L12 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALR3Q96L12 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALR3Q96L12 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALR3Q96L12 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALR3Q96L12 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALR3Q96L12 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALR3Q96L12 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALR3Q96L12 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms