Protein–RNA interactions for Protein: Q96L03

SPATA17, Spermatogenesis-associated protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA17Q96L03 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPATA17Q96L03 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPATA17Q96L03 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPATA17Q96L03 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPATA17Q96L03 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPATA17Q96L03 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPATA17Q96L03 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SPATA17Q96L03 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SPATA17Q96L03 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPATA17Q96L03 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPATA17Q96L03 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPATA17Q96L03 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPATA17Q96L03 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPATA17Q96L03 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPATA17Q96L03 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPATA17Q96L03 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPATA17Q96L03 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPATA17Q96L03 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPATA17Q96L03 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SPATA17Q96L03 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPATA17Q96L03 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPATA17Q96L03 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPATA17Q96L03 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPATA17Q96L03 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPATA17Q96L03 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPATA17Q96L03 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPATA17Q96L03 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPATA17Q96L03 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPATA17Q96L03 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPATA17Q96L03 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPATA17Q96L03 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPATA17Q96L03 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPATA17Q96L03 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPATA17Q96L03 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPATA17Q96L03 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPATA17Q96L03 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPATA17Q96L03 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPATA17Q96L03 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPATA17Q96L03 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPATA17Q96L03 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPATA17Q96L03 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPATA17Q96L03 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPATA17Q96L03 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPATA17Q96L03 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SPATA17Q96L03 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPATA17Q96L03 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPATA17Q96L03 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SPATA17Q96L03 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SPATA17Q96L03 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPATA17Q96L03 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SPATA17Q96L03 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SPATA17Q96L03 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SPATA17Q96L03 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPATA17Q96L03 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SPATA17Q96L03 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPATA17Q96L03 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SPATA17Q96L03 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SPATA17Q96L03 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPATA17Q96L03 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPATA17Q96L03 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPATA17Q96L03 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPATA17Q96L03 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA17Q96L03 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA17Q96L03 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA17Q96L03 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA17Q96L03 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA17Q96L03 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA17Q96L03 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA17Q96L03 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA17Q96L03 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA17Q96L03 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA17Q96L03 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPATA17Q96L03 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPATA17Q96L03 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPATA17Q96L03 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPATA17Q96L03 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPATA17Q96L03 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPATA17Q96L03 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPATA17Q96L03 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPATA17Q96L03 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPATA17Q96L03 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPATA17Q96L03 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPATA17Q96L03 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SPATA17Q96L03 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPATA17Q96L03 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPATA17Q96L03 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SPATA17Q96L03 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPATA17Q96L03 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SPATA17Q96L03 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPATA17Q96L03 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPATA17Q96L03 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPATA17Q96L03 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPATA17Q96L03 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPATA17Q96L03 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPATA17Q96L03 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPATA17Q96L03 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPATA17Q96L03 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPATA17Q96L03 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPATA17Q96L03 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPATA17Q96L03 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms