Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNIP3Q96KP6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNIP3Q96KP6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNIP3Q96KP6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNIP3Q96KP6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNIP3Q96KP6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TNIP3Q96KP6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNIP3Q96KP6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNIP3Q96KP6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNIP3Q96KP6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNIP3Q96KP6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNIP3Q96KP6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNIP3Q96KP6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNIP3Q96KP6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNIP3Q96KP6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNIP3Q96KP6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNIP3Q96KP6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNIP3Q96KP6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNIP3Q96KP6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNIP3Q96KP6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNIP3Q96KP6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNIP3Q96KP6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNIP3Q96KP6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNIP3Q96KP6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNIP3Q96KP6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNIP3Q96KP6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNIP3Q96KP6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNIP3Q96KP6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNIP3Q96KP6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNIP3Q96KP6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNIP3Q96KP6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNIP3Q96KP6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TNIP3Q96KP6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNIP3Q96KP6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNIP3Q96KP6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNIP3Q96KP6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNIP3Q96KP6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNIP3Q96KP6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNIP3Q96KP6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNIP3Q96KP6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNIP3Q96KP6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNIP3Q96KP6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TNIP3Q96KP6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNIP3Q96KP6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNIP3Q96KP6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNIP3Q96KP6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNIP3Q96KP6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNIP3Q96KP6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNIP3Q96KP6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNIP3Q96KP6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNIP3Q96KP6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNIP3Q96KP6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNIP3Q96KP6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNIP3Q96KP6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TNIP3Q96KP6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNIP3Q96KP6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNIP3Q96KP6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNIP3Q96KP6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNIP3Q96KP6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNIP3Q96KP6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TNIP3Q96KP6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNIP3Q96KP6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNIP3Q96KP6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNIP3Q96KP6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNIP3Q96KP6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNIP3Q96KP6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNIP3Q96KP6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNIP3Q96KP6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNIP3Q96KP6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNIP3Q96KP6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNIP3Q96KP6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNIP3Q96KP6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNIP3Q96KP6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNIP3Q96KP6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNIP3Q96KP6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNIP3Q96KP6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNIP3Q96KP6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNIP3Q96KP6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNIP3Q96KP6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNIP3Q96KP6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNIP3Q96KP6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNIP3Q96KP6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNIP3Q96KP6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNIP3Q96KP6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNIP3Q96KP6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNIP3Q96KP6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNIP3Q96KP6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TNIP3Q96KP6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TNIP3Q96KP6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNIP3Q96KP6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNIP3Q96KP6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNIP3Q96KP6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNIP3Q96KP6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNIP3Q96KP6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNIP3Q96KP6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNIP3Q96KP6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNIP3Q96KP6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNIP3Q96KP6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNIP3Q96KP6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNIP3Q96KP6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms