Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM3Q96HU1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
SGSM3Q96HU1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SGSM3Q96HU1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGSM3Q96HU1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGSM3Q96HU1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGSM3Q96HU1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGSM3Q96HU1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM3Q96HU1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM3Q96HU1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM3Q96HU1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM3Q96HU1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM3Q96HU1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM3Q96HU1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM3Q96HU1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM3Q96HU1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGSM3Q96HU1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGSM3Q96HU1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGSM3Q96HU1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGSM3Q96HU1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGSM3Q96HU1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGSM3Q96HU1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGSM3Q96HU1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGSM3Q96HU1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGSM3Q96HU1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGSM3Q96HU1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SGSM3Q96HU1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SGSM3Q96HU1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SGSM3Q96HU1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SGSM3Q96HU1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SGSM3Q96HU1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SGSM3Q96HU1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SGSM3Q96HU1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SGSM3Q96HU1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SGSM3Q96HU1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SGSM3Q96HU1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGSM3Q96HU1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGSM3Q96HU1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SGSM3Q96HU1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SGSM3Q96HU1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SGSM3Q96HU1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SGSM3Q96HU1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGSM3Q96HU1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGSM3Q96HU1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGSM3Q96HU1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGSM3Q96HU1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGSM3Q96HU1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGSM3Q96HU1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGSM3Q96HU1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms