Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TIMD4Q96H15 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMD4Q96H15 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMD4Q96H15 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMD4Q96H15 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMD4Q96H15 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMD4Q96H15 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMD4Q96H15 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMD4Q96H15 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMD4Q96H15 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMD4Q96H15 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMD4Q96H15 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMD4Q96H15 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TIMD4Q96H15 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TIMD4Q96H15 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMD4Q96H15 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMD4Q96H15 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMD4Q96H15 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMD4Q96H15 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMD4Q96H15 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMD4Q96H15 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMD4Q96H15 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMD4Q96H15 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMD4Q96H15 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMD4Q96H15 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMD4Q96H15 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMD4Q96H15 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMD4Q96H15 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMD4Q96H15 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMD4Q96H15 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMD4Q96H15 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMD4Q96H15 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMD4Q96H15 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMD4Q96H15 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMD4Q96H15 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMD4Q96H15 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMD4Q96H15 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMD4Q96H15 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMD4Q96H15 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMD4Q96H15 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMD4Q96H15 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMD4Q96H15 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMD4Q96H15 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMD4Q96H15 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TIMD4Q96H15 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TIMD4Q96H15 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TIMD4Q96H15 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TIMD4Q96H15 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TIMD4Q96H15 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TIMD4Q96H15 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TIMD4Q96H15 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TIMD4Q96H15 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TIMD4Q96H15 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TIMD4Q96H15 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TIMD4Q96H15 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TIMD4Q96H15 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TIMD4Q96H15 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms