Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX27Q96GQ7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX27Q96GQ7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX27Q96GQ7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX27Q96GQ7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX27Q96GQ7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX27Q96GQ7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX27Q96GQ7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX27Q96GQ7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX27Q96GQ7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX27Q96GQ7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX27Q96GQ7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX27Q96GQ7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX27Q96GQ7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX27Q96GQ7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX27Q96GQ7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
DDX27Q96GQ7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX27Q96GQ7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX27Q96GQ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX27Q96GQ7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX27Q96GQ7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX27Q96GQ7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX27Q96GQ7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX27Q96GQ7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX27Q96GQ7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX27Q96GQ7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX27Q96GQ7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX27Q96GQ7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX27Q96GQ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX27Q96GQ7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX27Q96GQ7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX27Q96GQ7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX27Q96GQ7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX27Q96GQ7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX27Q96GQ7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX27Q96GQ7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX27Q96GQ7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX27Q96GQ7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX27Q96GQ7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX27Q96GQ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX27Q96GQ7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX27Q96GQ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX27Q96GQ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX27Q96GQ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX27Q96GQ7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX27Q96GQ7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX27Q96GQ7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX27Q96GQ7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX27Q96GQ7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX27Q96GQ7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX27Q96GQ7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX27Q96GQ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX27Q96GQ7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX27Q96GQ7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX27Q96GQ7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX27Q96GQ7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX27Q96GQ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX27Q96GQ7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX27Q96GQ7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
DDX27Q96GQ7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX27Q96GQ7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX27Q96GQ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX27Q96GQ7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX27Q96GQ7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX27Q96GQ7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX27Q96GQ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX27Q96GQ7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX27Q96GQ7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX27Q96GQ7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX27Q96GQ7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX27Q96GQ7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX27Q96GQ7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DDX27Q96GQ7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms