Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD0

PDXP, Pyridoxal phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXPQ96GD0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDXPQ96GD0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDXPQ96GD0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDXPQ96GD0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDXPQ96GD0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDXPQ96GD0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDXPQ96GD0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDXPQ96GD0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDXPQ96GD0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDXPQ96GD0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDXPQ96GD0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDXPQ96GD0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDXPQ96GD0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDXPQ96GD0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDXPQ96GD0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDXPQ96GD0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDXPQ96GD0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDXPQ96GD0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDXPQ96GD0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDXPQ96GD0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDXPQ96GD0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDXPQ96GD0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDXPQ96GD0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDXPQ96GD0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDXPQ96GD0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDXPQ96GD0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDXPQ96GD0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDXPQ96GD0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDXPQ96GD0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDXPQ96GD0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDXPQ96GD0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PDXPQ96GD0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDXPQ96GD0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDXPQ96GD0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDXPQ96GD0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDXPQ96GD0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDXPQ96GD0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDXPQ96GD0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDXPQ96GD0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDXPQ96GD0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PDXPQ96GD0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDXPQ96GD0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDXPQ96GD0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDXPQ96GD0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDXPQ96GD0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDXPQ96GD0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDXPQ96GD0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDXPQ96GD0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDXPQ96GD0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDXPQ96GD0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDXPQ96GD0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDXPQ96GD0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDXPQ96GD0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDXPQ96GD0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDXPQ96GD0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDXPQ96GD0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDXPQ96GD0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDXPQ96GD0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PDXPQ96GD0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDXPQ96GD0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDXPQ96GD0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDXPQ96GD0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDXPQ96GD0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDXPQ96GD0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDXPQ96GD0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDXPQ96GD0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDXPQ96GD0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDXPQ96GD0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDXPQ96GD0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PDXPQ96GD0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PDXPQ96GD0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PDXPQ96GD0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDXPQ96GD0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDXPQ96GD0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDXPQ96GD0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDXPQ96GD0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDXPQ96GD0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDXPQ96GD0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDXPQ96GD0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDXPQ96GD0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDXPQ96GD0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDXPQ96GD0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDXPQ96GD0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDXPQ96GD0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDXPQ96GD0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDXPQ96GD0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDXPQ96GD0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDXPQ96GD0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDXPQ96GD0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDXPQ96GD0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDXPQ96GD0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms