Protein–RNA interactions for Protein: Q96FX8

PERP, p53 apoptosis effector related to PMP-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERPQ96FX8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PERPQ96FX8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PERPQ96FX8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PERPQ96FX8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PERPQ96FX8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PERPQ96FX8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PERPQ96FX8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PERPQ96FX8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PERPQ96FX8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PERPQ96FX8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PERPQ96FX8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PERPQ96FX8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PERPQ96FX8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PERPQ96FX8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PERPQ96FX8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PERPQ96FX8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PERPQ96FX8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PERPQ96FX8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PERPQ96FX8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PERPQ96FX8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PERPQ96FX8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PERPQ96FX8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PERPQ96FX8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PERPQ96FX8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PERPQ96FX8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PERPQ96FX8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PERPQ96FX8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PERPQ96FX8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PERPQ96FX8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PERPQ96FX8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PERPQ96FX8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PERPQ96FX8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PERPQ96FX8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PERPQ96FX8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PERPQ96FX8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PERPQ96FX8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PERPQ96FX8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PERPQ96FX8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PERPQ96FX8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PERPQ96FX8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PERPQ96FX8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PERPQ96FX8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PERPQ96FX8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PERPQ96FX8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PERPQ96FX8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms