Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYFIP2Q96F07 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYFIP2Q96F07 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYFIP2Q96F07 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYFIP2Q96F07 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYFIP2Q96F07 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYFIP2Q96F07 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYFIP2Q96F07 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYFIP2Q96F07 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYFIP2Q96F07 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYFIP2Q96F07 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYFIP2Q96F07 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYFIP2Q96F07 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYFIP2Q96F07 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYFIP2Q96F07 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYFIP2Q96F07 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYFIP2Q96F07 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYFIP2Q96F07 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CYFIP2Q96F07 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYFIP2Q96F07 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYFIP2Q96F07 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYFIP2Q96F07 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYFIP2Q96F07 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYFIP2Q96F07 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYFIP2Q96F07 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYFIP2Q96F07 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYFIP2Q96F07 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYFIP2Q96F07 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYFIP2Q96F07 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYFIP2Q96F07 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYFIP2Q96F07 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYFIP2Q96F07 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYFIP2Q96F07 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYFIP2Q96F07 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYFIP2Q96F07 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYFIP2Q96F07 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYFIP2Q96F07 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYFIP2Q96F07 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYFIP2Q96F07 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYFIP2Q96F07 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYFIP2Q96F07 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYFIP2Q96F07 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CYFIP2Q96F07 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYFIP2Q96F07 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYFIP2Q96F07 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYFIP2Q96F07 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYFIP2Q96F07 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYFIP2Q96F07 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
CYFIP2Q96F07 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYFIP2Q96F07 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYFIP2Q96F07 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CYFIP2Q96F07 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYFIP2Q96F07 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYFIP2Q96F07 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYFIP2Q96F07 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYFIP2Q96F07 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYFIP2Q96F07 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CYFIP2Q96F07 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CYFIP2Q96F07 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYFIP2Q96F07 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms