Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM12Q96EX1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM12Q96EX1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM12Q96EX1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM12Q96EX1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM12Q96EX1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM12Q96EX1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM12Q96EX1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM12Q96EX1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM12Q96EX1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM12Q96EX1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM12Q96EX1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM12Q96EX1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM12Q96EX1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM12Q96EX1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM12Q96EX1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM12Q96EX1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM12Q96EX1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM12Q96EX1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM12Q96EX1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM12Q96EX1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM12Q96EX1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM12Q96EX1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SMIM12Q96EX1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM12Q96EX1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM12Q96EX1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM12Q96EX1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM12Q96EX1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM12Q96EX1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM12Q96EX1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM12Q96EX1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM12Q96EX1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM12Q96EX1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM12Q96EX1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM12Q96EX1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM12Q96EX1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM12Q96EX1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM12Q96EX1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM12Q96EX1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM12Q96EX1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM12Q96EX1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM12Q96EX1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM12Q96EX1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM12Q96EX1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM12Q96EX1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMIM12Q96EX1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMIM12Q96EX1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM12Q96EX1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM12Q96EX1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM12Q96EX1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM12Q96EX1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM12Q96EX1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMIM12Q96EX1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM12Q96EX1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMIM12Q96EX1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM12Q96EX1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM12Q96EX1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM12Q96EX1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM12Q96EX1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM12Q96EX1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM12Q96EX1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM12Q96EX1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM12Q96EX1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM12Q96EX1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM12Q96EX1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM12Q96EX1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM12Q96EX1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM12Q96EX1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMIM12Q96EX1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMIM12Q96EX1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMIM12Q96EX1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMIM12Q96EX1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMIM12Q96EX1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMIM12Q96EX1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM12Q96EX1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM12Q96EX1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM12Q96EX1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM12Q96EX1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMIM12Q96EX1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM12Q96EX1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM12Q96EX1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM12Q96EX1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM12Q96EX1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM12Q96EX1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMIM12Q96EX1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM12Q96EX1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms