Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTERF3Q96E29 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTERF3Q96E29 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTERF3Q96E29 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTERF3Q96E29 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTERF3Q96E29 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTERF3Q96E29 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTERF3Q96E29 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTERF3Q96E29 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTERF3Q96E29 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTERF3Q96E29 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTERF3Q96E29 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTERF3Q96E29 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTERF3Q96E29 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTERF3Q96E29 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTERF3Q96E29 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTERF3Q96E29 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTERF3Q96E29 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTERF3Q96E29 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTERF3Q96E29 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTERF3Q96E29 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTERF3Q96E29 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTERF3Q96E29 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MTERF3Q96E29 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTERF3Q96E29 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTERF3Q96E29 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTERF3Q96E29 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTERF3Q96E29 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTERF3Q96E29 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTERF3Q96E29 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTERF3Q96E29 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTERF3Q96E29 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTERF3Q96E29 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTERF3Q96E29 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTERF3Q96E29 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTERF3Q96E29 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTERF3Q96E29 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTERF3Q96E29 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTERF3Q96E29 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTERF3Q96E29 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTERF3Q96E29 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTERF3Q96E29 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTERF3Q96E29 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTERF3Q96E29 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTERF3Q96E29 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTERF3Q96E29 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTERF3Q96E29 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTERF3Q96E29 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTERF3Q96E29 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTERF3Q96E29 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTERF3Q96E29 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTERF3Q96E29 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTERF3Q96E29 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTERF3Q96E29 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTERF3Q96E29 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTERF3Q96E29 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTERF3Q96E29 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTERF3Q96E29 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTERF3Q96E29 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTERF3Q96E29 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTERF3Q96E29 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTERF3Q96E29 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTERF3Q96E29 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTERF3Q96E29 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTERF3Q96E29 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTERF3Q96E29 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTERF3Q96E29 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTERF3Q96E29 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTERF3Q96E29 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTERF3Q96E29 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTERF3Q96E29 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTERF3Q96E29 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTERF3Q96E29 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MTERF3Q96E29 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTERF3Q96E29 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MTERF3Q96E29 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTERF3Q96E29 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTERF3Q96E29 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTERF3Q96E29 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MTERF3Q96E29 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTERF3Q96E29 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTERF3Q96E29 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms