Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMTM5Q96DZ9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMTM5Q96DZ9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMTM5Q96DZ9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMTM5Q96DZ9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTM5Q96DZ9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTM5Q96DZ9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTM5Q96DZ9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTM5Q96DZ9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTM5Q96DZ9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CMTM5Q96DZ9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CMTM5Q96DZ9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTM5Q96DZ9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CMTM5Q96DZ9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CMTM5Q96DZ9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CMTM5Q96DZ9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CMTM5Q96DZ9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CMTM5Q96DZ9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CMTM5Q96DZ9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CMTM5Q96DZ9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CMTM5Q96DZ9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMTM5Q96DZ9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CMTM5Q96DZ9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CMTM5Q96DZ9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CMTM5Q96DZ9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CMTM5Q96DZ9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CMTM5Q96DZ9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CMTM5Q96DZ9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CMTM5Q96DZ9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CMTM5Q96DZ9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CMTM5Q96DZ9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CMTM5Q96DZ9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CMTM5Q96DZ9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CMTM5Q96DZ9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CMTM5Q96DZ9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CMTM5Q96DZ9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CMTM5Q96DZ9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CMTM5Q96DZ9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CMTM5Q96DZ9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CMTM5Q96DZ9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMTM5Q96DZ9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMTM5Q96DZ9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMTM5Q96DZ9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMTM5Q96DZ9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMTM5Q96DZ9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMTM5Q96DZ9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMTM5Q96DZ9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMTM5Q96DZ9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMTM5Q96DZ9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMTM5Q96DZ9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMTM5Q96DZ9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMTM5Q96DZ9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMTM5Q96DZ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMTM5Q96DZ9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMTM5Q96DZ9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CMTM5Q96DZ9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CMTM5Q96DZ9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMTM5Q96DZ9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMTM5Q96DZ9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMTM5Q96DZ9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMTM5Q96DZ9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMTM5Q96DZ9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMTM5Q96DZ9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMTM5Q96DZ9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMTM5Q96DZ9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMTM5Q96DZ9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CMTM5Q96DZ9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CMTM5Q96DZ9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CMTM5Q96DZ9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CMTM5Q96DZ9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CMTM5Q96DZ9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CMTM5Q96DZ9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CMTM5Q96DZ9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CMTM5Q96DZ9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CMTM5Q96DZ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CMTM5Q96DZ9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CMTM5Q96DZ9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CMTM5Q96DZ9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms