Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC58Q96CX6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC58Q96CX6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC58Q96CX6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC58Q96CX6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC58Q96CX6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC58Q96CX6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC58Q96CX6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC58Q96CX6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC58Q96CX6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC58Q96CX6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC58Q96CX6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC58Q96CX6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC58Q96CX6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC58Q96CX6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC58Q96CX6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC58Q96CX6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC58Q96CX6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC58Q96CX6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC58Q96CX6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC58Q96CX6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC58Q96CX6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC58Q96CX6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC58Q96CX6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC58Q96CX6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC58Q96CX6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC58Q96CX6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC58Q96CX6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC58Q96CX6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC58Q96CX6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC58Q96CX6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC58Q96CX6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC58Q96CX6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC58Q96CX6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC58Q96CX6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC58Q96CX6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC58Q96CX6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC58Q96CX6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC58Q96CX6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC58Q96CX6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC58Q96CX6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC58Q96CX6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC58Q96CX6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC58Q96CX6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC58Q96CX6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC58Q96CX6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC58Q96CX6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC58Q96CX6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC58Q96CX6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC58Q96CX6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC58Q96CX6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC58Q96CX6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms