Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TLCD1Q96CP7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TLCD1Q96CP7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TLCD1Q96CP7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TLCD1Q96CP7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TLCD1Q96CP7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TLCD1Q96CP7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TLCD1Q96CP7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TLCD1Q96CP7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TLCD1Q96CP7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TLCD1Q96CP7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TLCD1Q96CP7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TLCD1Q96CP7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TLCD1Q96CP7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TLCD1Q96CP7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TLCD1Q96CP7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TLCD1Q96CP7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TLCD1Q96CP7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TLCD1Q96CP7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TLCD1Q96CP7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TLCD1Q96CP7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TLCD1Q96CP7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TLCD1Q96CP7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TLCD1Q96CP7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TLCD1Q96CP7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TLCD1Q96CP7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TLCD1Q96CP7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TLCD1Q96CP7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TLCD1Q96CP7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TLCD1Q96CP7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TLCD1Q96CP7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TLCD1Q96CP7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TLCD1Q96CP7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TLCD1Q96CP7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TLCD1Q96CP7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TLCD1Q96CP7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TLCD1Q96CP7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TLCD1Q96CP7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TLCD1Q96CP7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TLCD1Q96CP7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TLCD1Q96CP7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TLCD1Q96CP7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TLCD1Q96CP7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TLCD1Q96CP7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TLCD1Q96CP7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TLCD1Q96CP7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TLCD1Q96CP7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TLCD1Q96CP7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TLCD1Q96CP7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TLCD1Q96CP7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TLCD1Q96CP7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TLCD1Q96CP7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TLCD1Q96CP7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TLCD1Q96CP7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TLCD1Q96CP7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TLCD1Q96CP7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TLCD1Q96CP7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TLCD1Q96CP7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TLCD1Q96CP7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TLCD1Q96CP7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TLCD1Q96CP7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TLCD1Q96CP7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TLCD1Q96CP7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TLCD1Q96CP7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TLCD1Q96CP7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TLCD1Q96CP7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TLCD1Q96CP7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TLCD1Q96CP7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TLCD1Q96CP7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TLCD1Q96CP7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TLCD1Q96CP7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TLCD1Q96CP7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TLCD1Q96CP7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TLCD1Q96CP7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TLCD1Q96CP7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TLCD1Q96CP7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TLCD1Q96CP7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TLCD1Q96CP7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TLCD1Q96CP7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TLCD1Q96CP7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TLCD1Q96CP7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TLCD1Q96CP7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TLCD1Q96CP7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TLCD1Q96CP7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TLCD1Q96CP7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TLCD1Q96CP7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TLCD1Q96CP7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TLCD1Q96CP7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TLCD1Q96CP7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TLCD1Q96CP7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TLCD1Q96CP7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TLCD1Q96CP7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TLCD1Q96CP7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TLCD1Q96CP7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TLCD1Q96CP7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TLCD1Q96CP7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TLCD1Q96CP7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TLCD1Q96CP7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TLCD1Q96CP7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TLCD1Q96CP7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms