Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDCCAG3Q96C92 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDCCAG3Q96C92 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDCCAG3Q96C92 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDCCAG3Q96C92 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDCCAG3Q96C92 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SDCCAG3Q96C92 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDCCAG3Q96C92 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDCCAG3Q96C92 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDCCAG3Q96C92 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDCCAG3Q96C92 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SDCCAG3Q96C92 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDCCAG3Q96C92 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SDCCAG3Q96C92 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDCCAG3Q96C92 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDCCAG3Q96C92 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDCCAG3Q96C92 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDCCAG3Q96C92 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDCCAG3Q96C92 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDCCAG3Q96C92 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDCCAG3Q96C92 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDCCAG3Q96C92 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDCCAG3Q96C92 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDCCAG3Q96C92 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDCCAG3Q96C92 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDCCAG3Q96C92 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDCCAG3Q96C92 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDCCAG3Q96C92 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDCCAG3Q96C92 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDCCAG3Q96C92 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDCCAG3Q96C92 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDCCAG3Q96C92 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDCCAG3Q96C92 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDCCAG3Q96C92 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDCCAG3Q96C92 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDCCAG3Q96C92 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDCCAG3Q96C92 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDCCAG3Q96C92 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDCCAG3Q96C92 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDCCAG3Q96C92 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDCCAG3Q96C92 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDCCAG3Q96C92 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDCCAG3Q96C92 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDCCAG3Q96C92 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDCCAG3Q96C92 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDCCAG3Q96C92 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDCCAG3Q96C92 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SDCCAG3Q96C92 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SDCCAG3Q96C92 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDCCAG3Q96C92 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms