Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
TRIM52Q96A61 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
TRIM52Q96A61 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TRIM52Q96A61 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TRIM52Q96A61 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TRIM52Q96A61 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC39.21■■■■□ 3.87
TRIM52Q96A61 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TRIM52Q96A61 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TRIM52Q96A61 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
TRIM52Q96A61 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TRIM52Q96A61 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TRIM52Q96A61 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
TRIM52Q96A61 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
TRIM52Q96A61 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
TRIM52Q96A61 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
TRIM52Q96A61 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
TRIM52Q96A61 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
TRIM52Q96A61 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
TRIM52Q96A61 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
TRIM52Q96A61 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
TRIM52Q96A61 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
TRIM52Q96A61 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
TRIM52Q96A61 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
TRIM52Q96A61 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
TRIM52Q96A61 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
TRIM52Q96A61 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
TRIM52Q96A61 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
TRIM52Q96A61 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
TRIM52Q96A61 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
TRIM52Q96A61 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
TRIM52Q96A61 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
TRIM52Q96A61 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
TRIM52Q96A61 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
TRIM52Q96A61 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
TRIM52Q96A61 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TRIM52Q96A61 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
TRIM52Q96A61 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.83
TRIM52Q96A61 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
TRIM52Q96A61 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TRIM52Q96A61 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
TRIM52Q96A61 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
TRIM52Q96A61 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
TRIM52Q96A61 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
TRIM52Q96A61 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
TRIM52Q96A61 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
TRIM52Q96A61 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
TRIM52Q96A61 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
TRIM52Q96A61 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
TRIM52Q96A61 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
TRIM52Q96A61 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
TRIM52Q96A61 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
TRIM52Q96A61 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
TRIM52Q96A61 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
TRIM52Q96A61 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
TRIM52Q96A61 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
TRIM52Q96A61 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
TRIM52Q96A61 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
TRIM52Q96A61 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
TRIM52Q96A61 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
TRIM52Q96A61 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
TRIM52Q96A61 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
TRIM52Q96A61 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.81■■■■□ 3.8
TRIM52Q96A61 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
TRIM52Q96A61 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
TRIM52Q96A61 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.79■■■■□ 3.8
TRIM52Q96A61 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
TRIM52Q96A61 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
TRIM52Q96A61 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
TRIM52Q96A61 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
TRIM52Q96A61 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
TRIM52Q96A61 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
TRIM52Q96A61 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
TRIM52Q96A61 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
TRIM52Q96A61 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
TRIM52Q96A61 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TRIM52Q96A61 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TRIM52Q96A61 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TRIM52Q96A61 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
TRIM52Q96A61 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TRIM52Q96A61 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TRIM52Q96A61 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC38.72■■■■□ 3.79
TRIM52Q96A61 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
TRIM52Q96A61 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
TRIM52Q96A61 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
TRIM52Q96A61 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
TRIM52Q96A61 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
TRIM52Q96A61 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
TRIM52Q96A61 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
TRIM52Q96A61 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
TRIM52Q96A61 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TRIM52Q96A61 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TRIM52Q96A61 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
TRIM52Q96A61 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TRIM52Q96A61 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TRIM52Q96A61 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
TRIM52Q96A61 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
TRIM52Q96A61 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TRIM52Q96A61 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TRIM52Q96A61 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TRIM52Q96A61 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms