Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYAP1Q96A49 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYAP1Q96A49 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYAP1Q96A49 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYAP1Q96A49 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYAP1Q96A49 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYAP1Q96A49 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYAP1Q96A49 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYAP1Q96A49 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYAP1Q96A49 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYAP1Q96A49 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYAP1Q96A49 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYAP1Q96A49 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYAP1Q96A49 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYAP1Q96A49 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYAP1Q96A49 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SYAP1Q96A49 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYAP1Q96A49 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYAP1Q96A49 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYAP1Q96A49 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYAP1Q96A49 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYAP1Q96A49 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYAP1Q96A49 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SYAP1Q96A49 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYAP1Q96A49 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYAP1Q96A49 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYAP1Q96A49 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYAP1Q96A49 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYAP1Q96A49 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYAP1Q96A49 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYAP1Q96A49 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYAP1Q96A49 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYAP1Q96A49 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYAP1Q96A49 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYAP1Q96A49 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYAP1Q96A49 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYAP1Q96A49 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYAP1Q96A49 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SYAP1Q96A49 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYAP1Q96A49 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYAP1Q96A49 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYAP1Q96A49 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYAP1Q96A49 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYAP1Q96A49 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYAP1Q96A49 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYAP1Q96A49 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYAP1Q96A49 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SYAP1Q96A49 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYAP1Q96A49 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYAP1Q96A49 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYAP1Q96A49 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYAP1Q96A49 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYAP1Q96A49 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYAP1Q96A49 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYAP1Q96A49 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYAP1Q96A49 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYAP1Q96A49 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYAP1Q96A49 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYAP1Q96A49 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYAP1Q96A49 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYAP1Q96A49 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYAP1Q96A49 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYAP1Q96A49 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYAP1Q96A49 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYAP1Q96A49 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYAP1Q96A49 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYAP1Q96A49 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYAP1Q96A49 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYAP1Q96A49 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYAP1Q96A49 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYAP1Q96A49 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYAP1Q96A49 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYAP1Q96A49 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYAP1Q96A49 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYAP1Q96A49 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYAP1Q96A49 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYAP1Q96A49 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYAP1Q96A49 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYAP1Q96A49 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYAP1Q96A49 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYAP1Q96A49 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYAP1Q96A49 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYAP1Q96A49 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYAP1Q96A49 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYAP1Q96A49 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYAP1Q96A49 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYAP1Q96A49 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYAP1Q96A49 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYAP1Q96A49 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYAP1Q96A49 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYAP1Q96A49 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYAP1Q96A49 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYAP1Q96A49 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYAP1Q96A49 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYAP1Q96A49 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYAP1Q96A49 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SYAP1Q96A49 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYAP1Q96A49 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYAP1Q96A49 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYAP1Q96A49 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms