Protein–RNA interactions for Protein: Q969V3

NCLN, Nicalin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLNQ969V3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCLNQ969V3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCLNQ969V3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCLNQ969V3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NCLNQ969V3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCLNQ969V3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCLNQ969V3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCLNQ969V3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCLNQ969V3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCLNQ969V3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCLNQ969V3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCLNQ969V3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCLNQ969V3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCLNQ969V3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCLNQ969V3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCLNQ969V3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCLNQ969V3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCLNQ969V3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCLNQ969V3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NCLNQ969V3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCLNQ969V3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCLNQ969V3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCLNQ969V3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCLNQ969V3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCLNQ969V3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCLNQ969V3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCLNQ969V3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCLNQ969V3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NCLNQ969V3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCLNQ969V3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCLNQ969V3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCLNQ969V3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCLNQ969V3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCLNQ969V3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCLNQ969V3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCLNQ969V3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCLNQ969V3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCLNQ969V3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NCLNQ969V3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCLNQ969V3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCLNQ969V3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCLNQ969V3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms