Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NKD2Q969F2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NKD2Q969F2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NKD2Q969F2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NKD2Q969F2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NKD2Q969F2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NKD2Q969F2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NKD2Q969F2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NKD2Q969F2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NKD2Q969F2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NKD2Q969F2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NKD2Q969F2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NKD2Q969F2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NKD2Q969F2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NKD2Q969F2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NKD2Q969F2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NKD2Q969F2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NKD2Q969F2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NKD2Q969F2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NKD2Q969F2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NKD2Q969F2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NKD2Q969F2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NKD2Q969F2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NKD2Q969F2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NKD2Q969F2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NKD2Q969F2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NKD2Q969F2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NKD2Q969F2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NKD2Q969F2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NKD2Q969F2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NKD2Q969F2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NKD2Q969F2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NKD2Q969F2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NKD2Q969F2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NKD2Q969F2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NKD2Q969F2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NKD2Q969F2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NKD2Q969F2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NKD2Q969F2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NKD2Q969F2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NKD2Q969F2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NKD2Q969F2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NKD2Q969F2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NKD2Q969F2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NKD2Q969F2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NKD2Q969F2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NKD2Q969F2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NKD2Q969F2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NKD2Q969F2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NKD2Q969F2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NKD2Q969F2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NKD2Q969F2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NKD2Q969F2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NKD2Q969F2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NKD2Q969F2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NKD2Q969F2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NKD2Q969F2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NKD2Q969F2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NKD2Q969F2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NKD2Q969F2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NKD2Q969F2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NKD2Q969F2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NKD2Q969F2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NKD2Q969F2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKD2Q969F2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKD2Q969F2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKD2Q969F2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKD2Q969F2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKD2Q969F2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKD2Q969F2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKD2Q969F2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKD2Q969F2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NKD2Q969F2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NKD2Q969F2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKD2Q969F2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKD2Q969F2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKD2Q969F2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKD2Q969F2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKD2Q969F2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKD2Q969F2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKD2Q969F2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKD2Q969F2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NKD2Q969F2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NKD2Q969F2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NKD2Q969F2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NKD2Q969F2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NKD2Q969F2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NKD2Q969F2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NKD2Q969F2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NKD2Q969F2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NKD2Q969F2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NKD2Q969F2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NKD2Q969F2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NKD2Q969F2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NKD2Q969F2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NKD2Q969F2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NKD2Q969F2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NKD2Q969F2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NKD2Q969F2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NKD2Q969F2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms