Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP13Q92995 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP13Q92995 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP13Q92995 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP13Q92995 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP13Q92995 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP13Q92995 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP13Q92995 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP13Q92995 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP13Q92995 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
USP13Q92995 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP13Q92995 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP13Q92995 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP13Q92995 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP13Q92995 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
USP13Q92995 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP13Q92995 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP13Q92995 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP13Q92995 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP13Q92995 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP13Q92995 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP13Q92995 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP13Q92995 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP13Q92995 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
USP13Q92995 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP13Q92995 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USP13Q92995 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USP13Q92995 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USP13Q92995 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP13Q92995 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP13Q92995 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP13Q92995 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP13Q92995 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP13Q92995 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP13Q92995 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP13Q92995 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP13Q92995 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP13Q92995 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
USP13Q92995 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP13Q92995 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP13Q92995 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP13Q92995 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP13Q92995 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP13Q92995 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
USP13Q92995 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP13Q92995 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP13Q92995 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP13Q92995 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP13Q92995 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP13Q92995 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP13Q92995 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP13Q92995 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
USP13Q92995 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP13Q92995 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP13Q92995 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP13Q92995 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP13Q92995 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
USP13Q92995 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP13Q92995 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP13Q92995 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP13Q92995 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP13Q92995 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP13Q92995 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP13Q92995 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP13Q92995 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP13Q92995 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP13Q92995 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP13Q92995 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP13Q92995 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP13Q92995 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP13Q92995 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP13Q92995 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP13Q92995 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP13Q92995 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP13Q92995 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP13Q92995 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP13Q92995 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP13Q92995 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP13Q92995 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP13Q92995 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP13Q92995 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP13Q92995 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP13Q92995 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP13Q92995 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP13Q92995 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP13Q92995 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP13Q92995 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP13Q92995 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
USP13Q92995 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP13Q92995 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP13Q92995 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP13Q92995 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP13Q92995 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP13Q92995 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP13Q92995 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP13Q92995 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP13Q92995 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP13Q92995 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP13Q92995 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP13Q92995 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms