Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PEX13Q92968 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PEX13Q92968 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PEX13Q92968 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PEX13Q92968 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PEX13Q92968 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PEX13Q92968 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PEX13Q92968 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PEX13Q92968 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PEX13Q92968 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PEX13Q92968 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PEX13Q92968 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PEX13Q92968 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PEX13Q92968 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PEX13Q92968 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PEX13Q92968 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PEX13Q92968 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PEX13Q92968 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PEX13Q92968 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PEX13Q92968 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PEX13Q92968 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PEX13Q92968 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PEX13Q92968 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PEX13Q92968 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PEX13Q92968 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PEX13Q92968 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PEX13Q92968 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PEX13Q92968 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PEX13Q92968 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PEX13Q92968 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PEX13Q92968 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PEX13Q92968 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PEX13Q92968 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PEX13Q92968 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PEX13Q92968 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PEX13Q92968 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PEX13Q92968 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PEX13Q92968 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PEX13Q92968 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PEX13Q92968 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PEX13Q92968 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PEX13Q92968 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX13Q92968 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX13Q92968 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX13Q92968 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PEX13Q92968 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PEX13Q92968 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PEX13Q92968 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PEX13Q92968 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PEX13Q92968 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PEX13Q92968 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PEX13Q92968 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PEX13Q92968 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PEX13Q92968 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PEX13Q92968 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PEX13Q92968 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PEX13Q92968 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PEX13Q92968 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PEX13Q92968 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PEX13Q92968 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PEX13Q92968 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PEX13Q92968 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PEX13Q92968 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PEX13Q92968 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PEX13Q92968 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX13Q92968 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX13Q92968 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX13Q92968 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PEX13Q92968 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX13Q92968 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX13Q92968 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX13Q92968 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX13Q92968 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX13Q92968 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX13Q92968 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX13Q92968 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PEX13Q92968 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms