Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF4BQ92750 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF4BQ92750 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF4BQ92750 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF4BQ92750 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TAF4BQ92750 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TAF4BQ92750 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TAF4BQ92750 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TAF4BQ92750 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TAF4BQ92750 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF4BQ92750 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF4BQ92750 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TAF4BQ92750 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TAF4BQ92750 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TAF4BQ92750 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TAF4BQ92750 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TAF4BQ92750 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TAF4BQ92750 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TAF4BQ92750 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TAF4BQ92750 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TAF4BQ92750 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF4BQ92750 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TAF4BQ92750 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TAF4BQ92750 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TAF4BQ92750 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TAF4BQ92750 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF4BQ92750 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF4BQ92750 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF4BQ92750 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF4BQ92750 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TAF4BQ92750 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TAF4BQ92750 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TAF4BQ92750 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TAF4BQ92750 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TAF4BQ92750 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TAF4BQ92750 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TAF4BQ92750 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF4BQ92750 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF4BQ92750 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF4BQ92750 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAF4BQ92750 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF4BQ92750 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF4BQ92750 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF4BQ92750 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF4BQ92750 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF4BQ92750 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF4BQ92750 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF4BQ92750 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
TAF4BQ92750 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF4BQ92750 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF4BQ92750 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF4BQ92750 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF4BQ92750 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF4BQ92750 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF4BQ92750 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF4BQ92750 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF4BQ92750 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF4BQ92750 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF4BQ92750 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF4BQ92750 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TAF4BQ92750 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TAF4BQ92750 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TAF4BQ92750 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF4BQ92750 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF4BQ92750 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF4BQ92750 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF4BQ92750 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TAF4BQ92750 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TAF4BQ92750 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF4BQ92750 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF4BQ92750 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF4BQ92750 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF4BQ92750 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF4BQ92750 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF4BQ92750 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF4BQ92750 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms