Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
TOPBP1Q92547 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.62■■■■■ 4.89
TOPBP1Q92547 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC45.61■■■■■ 4.89
TOPBP1Q92547 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.61■■■■■ 4.89
TOPBP1Q92547 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
TOPBP1Q92547 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC45.6■■■■■ 4.89
TOPBP1Q92547 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.59■■■■■ 4.89
TOPBP1Q92547 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
TOPBP1Q92547 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
TOPBP1Q92547 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
TOPBP1Q92547 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
TOPBP1Q92547 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
TOPBP1Q92547 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
TOPBP1Q92547 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
TOPBP1Q92547 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
TOPBP1Q92547 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
TOPBP1Q92547 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
TOPBP1Q92547 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
TOPBP1Q92547 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
TOPBP1Q92547 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
TOPBP1Q92547 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
TOPBP1Q92547 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
TOPBP1Q92547 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC45.5■■■■■ 4.87
TOPBP1Q92547 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
TOPBP1Q92547 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
TOPBP1Q92547 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
TOPBP1Q92547 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
TOPBP1Q92547 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
TOPBP1Q92547 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
TOPBP1Q92547 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
TOPBP1Q92547 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC45.41■■■■■ 4.86
TOPBP1Q92547 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
TOPBP1Q92547 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
TOPBP1Q92547 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
TOPBP1Q92547 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC45.41■■■■■ 4.86
TOPBP1Q92547 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
TOPBP1Q92547 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
TOPBP1Q92547 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
TOPBP1Q92547 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
TOPBP1Q92547 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.85
TOPBP1Q92547 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.36■■■■■ 4.85
TOPBP1Q92547 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
TOPBP1Q92547 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
TOPBP1Q92547 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
TOPBP1Q92547 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
TOPBP1Q92547 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC45.32■■■■■ 4.85
TOPBP1Q92547 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC45.31■■■■■ 4.84
TOPBP1Q92547 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
TOPBP1Q92547 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
TOPBP1Q92547 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
TOPBP1Q92547 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC45.29■■■■■ 4.84
TOPBP1Q92547 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
TOPBP1Q92547 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC45.27■■■■■ 4.84
TOPBP1Q92547 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC45.27■■■■■ 4.84
TOPBP1Q92547 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
TOPBP1Q92547 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
TOPBP1Q92547 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
TOPBP1Q92547 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
TOPBP1Q92547 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
TOPBP1Q92547 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
TOPBP1Q92547 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
TOPBP1Q92547 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC45.19■■■■■ 4.82
TOPBP1Q92547 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
TOPBP1Q92547 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
TOPBP1Q92547 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
TOPBP1Q92547 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
TOPBP1Q92547 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
TOPBP1Q92547 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
TOPBP1Q92547 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.14■■■■■ 4.82
TOPBP1Q92547 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
TOPBP1Q92547 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
TOPBP1Q92547 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
TOPBP1Q92547 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC45.11■■■■■ 4.81
TOPBP1Q92547 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC45.11■■■■■ 4.81
TOPBP1Q92547 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.09■■■■■ 4.81
TOPBP1Q92547 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
TOPBP1Q92547 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC45.08■■■■■ 4.81
TOPBP1Q92547 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC45.06■■■■■ 4.8
TOPBP1Q92547 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC45.06■■■■■ 4.8
TOPBP1Q92547 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
TOPBP1Q92547 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
TOPBP1Q92547 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
TOPBP1Q92547 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
TOPBP1Q92547 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
TOPBP1Q92547 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
TOPBP1Q92547 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
TOPBP1Q92547 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC45■■■■■ 4.79
TOPBP1Q92547 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.99■■■■■ 4.79
TOPBP1Q92547 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
TOPBP1Q92547 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
TOPBP1Q92547 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC44.96■■■■■ 4.79
TOPBP1Q92547 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC44.95■■■■■ 4.79
TOPBP1Q92547 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC44.95■■■■■ 4.79
TOPBP1Q92547 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
TOPBP1Q92547 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC44.94■■■■■ 4.78
TOPBP1Q92547 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC44.93■■■■■ 4.78
TOPBP1Q92547 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
TOPBP1Q92547 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
TOPBP1Q92547 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
TOPBP1Q92547 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms