Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPDL3BQ92485 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPDL3BQ92485 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPDL3BQ92485 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPDL3BQ92485 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMPDL3BQ92485 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPDL3BQ92485 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMPDL3BQ92485 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPDL3BQ92485 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPDL3BQ92485 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPDL3BQ92485 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPDL3BQ92485 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPDL3BQ92485 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPDL3BQ92485 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPDL3BQ92485 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMPDL3BQ92485 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPDL3BQ92485 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPDL3BQ92485 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPDL3BQ92485 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPDL3BQ92485 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPDL3BQ92485 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMPDL3BQ92485 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMPDL3BQ92485 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPDL3BQ92485 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPDL3BQ92485 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPDL3BQ92485 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPDL3BQ92485 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPDL3BQ92485 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMPDL3BQ92485 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMPDL3BQ92485 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPDL3BQ92485 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPDL3BQ92485 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPDL3BQ92485 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPDL3BQ92485 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPDL3BQ92485 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPDL3BQ92485 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPDL3BQ92485 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPDL3BQ92485 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPDL3BQ92485 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPDL3BQ92485 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPDL3BQ92485 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPDL3BQ92485 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPDL3BQ92485 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPDL3BQ92485 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPDL3BQ92485 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPDL3BQ92485 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMPDL3BQ92485 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMPDL3BQ92485 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMPDL3BQ92485 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPDL3BQ92485 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms