Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
LMO7Q8WWI1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
LMO7Q8WWI1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
LMO7Q8WWI1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
LMO7Q8WWI1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
LMO7Q8WWI1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
LMO7Q8WWI1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
LMO7Q8WWI1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
LMO7Q8WWI1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
LMO7Q8WWI1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
LMO7Q8WWI1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
LMO7Q8WWI1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
LMO7Q8WWI1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
LMO7Q8WWI1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
LMO7Q8WWI1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
LMO7Q8WWI1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
LMO7Q8WWI1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
LMO7Q8WWI1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
LMO7Q8WWI1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
LMO7Q8WWI1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
LMO7Q8WWI1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
LMO7Q8WWI1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
LMO7Q8WWI1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
LMO7Q8WWI1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
LMO7Q8WWI1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
LMO7Q8WWI1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
LMO7Q8WWI1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LMO7Q8WWI1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LMO7Q8WWI1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
LMO7Q8WWI1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LMO7Q8WWI1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LMO7Q8WWI1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LMO7Q8WWI1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LMO7Q8WWI1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
LMO7Q8WWI1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
LMO7Q8WWI1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
LMO7Q8WWI1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
LMO7Q8WWI1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
LMO7Q8WWI1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
LMO7Q8WWI1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
LMO7Q8WWI1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
LMO7Q8WWI1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
LMO7Q8WWI1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
LMO7Q8WWI1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
LMO7Q8WWI1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
LMO7Q8WWI1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
LMO7Q8WWI1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
LMO7Q8WWI1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
LMO7Q8WWI1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LMO7Q8WWI1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
LMO7Q8WWI1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
LMO7Q8WWI1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LMO7Q8WWI1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
LMO7Q8WWI1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LMO7Q8WWI1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LMO7Q8WWI1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LMO7Q8WWI1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LMO7Q8WWI1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LMO7Q8WWI1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LMO7Q8WWI1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LMO7Q8WWI1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LMO7Q8WWI1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
LMO7Q8WWI1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
LMO7Q8WWI1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LMO7Q8WWI1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LMO7Q8WWI1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LMO7Q8WWI1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LMO7Q8WWI1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LMO7Q8WWI1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
LMO7Q8WWI1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
LMO7Q8WWI1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
LMO7Q8WWI1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
LMO7Q8WWI1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LMO7Q8WWI1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LMO7Q8WWI1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
LMO7Q8WWI1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
LMO7Q8WWI1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
LMO7Q8WWI1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
LMO7Q8WWI1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
LMO7Q8WWI1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LMO7Q8WWI1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
LMO7Q8WWI1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LMO7Q8WWI1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
LMO7Q8WWI1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
LMO7Q8WWI1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
LMO7Q8WWI1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
LMO7Q8WWI1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LMO7Q8WWI1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
LMO7Q8WWI1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
LMO7Q8WWI1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
LMO7Q8WWI1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
LMO7Q8WWI1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
LMO7Q8WWI1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
LMO7Q8WWI1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
LMO7Q8WWI1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
LMO7Q8WWI1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
LMO7Q8WWI1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
LMO7Q8WWI1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LMO7Q8WWI1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LMO7Q8WWI1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms