Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWH5

TRUB1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB1Q8WWH5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRUB1Q8WWH5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRUB1Q8WWH5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRUB1Q8WWH5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRUB1Q8WWH5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRUB1Q8WWH5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRUB1Q8WWH5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRUB1Q8WWH5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRUB1Q8WWH5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRUB1Q8WWH5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRUB1Q8WWH5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRUB1Q8WWH5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRUB1Q8WWH5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRUB1Q8WWH5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRUB1Q8WWH5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRUB1Q8WWH5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRUB1Q8WWH5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRUB1Q8WWH5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRUB1Q8WWH5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRUB1Q8WWH5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRUB1Q8WWH5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRUB1Q8WWH5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRUB1Q8WWH5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRUB1Q8WWH5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRUB1Q8WWH5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRUB1Q8WWH5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRUB1Q8WWH5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRUB1Q8WWH5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRUB1Q8WWH5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRUB1Q8WWH5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRUB1Q8WWH5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRUB1Q8WWH5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRUB1Q8WWH5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRUB1Q8WWH5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRUB1Q8WWH5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRUB1Q8WWH5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRUB1Q8WWH5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRUB1Q8WWH5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRUB1Q8WWH5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRUB1Q8WWH5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRUB1Q8WWH5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRUB1Q8WWH5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRUB1Q8WWH5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRUB1Q8WWH5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRUB1Q8WWH5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRUB1Q8WWH5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRUB1Q8WWH5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRUB1Q8WWH5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRUB1Q8WWH5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRUB1Q8WWH5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRUB1Q8WWH5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRUB1Q8WWH5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRUB1Q8WWH5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRUB1Q8WWH5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRUB1Q8WWH5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRUB1Q8WWH5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRUB1Q8WWH5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRUB1Q8WWH5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRUB1Q8WWH5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRUB1Q8WWH5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRUB1Q8WWH5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRUB1Q8WWH5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRUB1Q8WWH5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRUB1Q8WWH5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRUB1Q8WWH5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRUB1Q8WWH5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRUB1Q8WWH5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRUB1Q8WWH5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRUB1Q8WWH5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRUB1Q8WWH5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRUB1Q8WWH5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRUB1Q8WWH5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRUB1Q8WWH5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRUB1Q8WWH5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRUB1Q8WWH5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms