Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSMCE1Q8WV22 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSMCE1Q8WV22 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSMCE1Q8WV22 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSMCE1Q8WV22 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSMCE1Q8WV22 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSMCE1Q8WV22 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSMCE1Q8WV22 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSMCE1Q8WV22 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NSMCE1Q8WV22 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSMCE1Q8WV22 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSMCE1Q8WV22 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSMCE1Q8WV22 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSMCE1Q8WV22 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSMCE1Q8WV22 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSMCE1Q8WV22 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSMCE1Q8WV22 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSMCE1Q8WV22 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSMCE1Q8WV22 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSMCE1Q8WV22 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSMCE1Q8WV22 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSMCE1Q8WV22 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSMCE1Q8WV22 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NSMCE1Q8WV22 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSMCE1Q8WV22 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NSMCE1Q8WV22 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSMCE1Q8WV22 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSMCE1Q8WV22 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NSMCE1Q8WV22 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSMCE1Q8WV22 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSMCE1Q8WV22 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSMCE1Q8WV22 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSMCE1Q8WV22 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSMCE1Q8WV22 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSMCE1Q8WV22 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSMCE1Q8WV22 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NSMCE1Q8WV22 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NSMCE1Q8WV22 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NSMCE1Q8WV22 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NSMCE1Q8WV22 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSMCE1Q8WV22 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSMCE1Q8WV22 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSMCE1Q8WV22 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSMCE1Q8WV22 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSMCE1Q8WV22 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSMCE1Q8WV22 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSMCE1Q8WV22 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSMCE1Q8WV22 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NSMCE1Q8WV22 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NSMCE1Q8WV22 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NSMCE1Q8WV22 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NSMCE1Q8WV22 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NSMCE1Q8WV22 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NSMCE1Q8WV22 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NSMCE1Q8WV22 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
NSMCE1Q8WV22 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
NSMCE1Q8WV22 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NSMCE1Q8WV22 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NSMCE1Q8WV22 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NSMCE1Q8WV22 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NSMCE1Q8WV22 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NSMCE1Q8WV22 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSMCE1Q8WV22 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSMCE1Q8WV22 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSMCE1Q8WV22 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSMCE1Q8WV22 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSMCE1Q8WV22 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSMCE1Q8WV22 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSMCE1Q8WV22 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSMCE1Q8WV22 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSMCE1Q8WV22 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSMCE1Q8WV22 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSMCE1Q8WV22 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NSMCE1Q8WV22 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSMCE1Q8WV22 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSMCE1Q8WV22 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSMCE1Q8WV22 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSMCE1Q8WV22 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSMCE1Q8WV22 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSMCE1Q8WV22 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSMCE1Q8WV22 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSMCE1Q8WV22 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSMCE1Q8WV22 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSMCE1Q8WV22 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSMCE1Q8WV22 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSMCE1Q8WV22 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSMCE1Q8WV22 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSMCE1Q8WV22 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSMCE1Q8WV22 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSMCE1Q8WV22 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSMCE1Q8WV22 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NSMCE1Q8WV22 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSMCE1Q8WV22 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSMCE1Q8WV22 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSMCE1Q8WV22 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NSMCE1Q8WV22 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSMCE1Q8WV22 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NSMCE1Q8WV22 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSMCE1Q8WV22 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSMCE1Q8WV22 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms