Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WHAMMQ8TF30 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WHAMMQ8TF30 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
WHAMMQ8TF30 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
WHAMMQ8TF30 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WHAMMQ8TF30 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WHAMMQ8TF30 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WHAMMQ8TF30 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
WHAMMQ8TF30 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
WHAMMQ8TF30 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
WHAMMQ8TF30 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
WHAMMQ8TF30 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WHAMMQ8TF30 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
WHAMMQ8TF30 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WHAMMQ8TF30 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WHAMMQ8TF30 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
WHAMMQ8TF30 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
WHAMMQ8TF30 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
WHAMMQ8TF30 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
WHAMMQ8TF30 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
WHAMMQ8TF30 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
WHAMMQ8TF30 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
WHAMMQ8TF30 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
WHAMMQ8TF30 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
WHAMMQ8TF30 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
WHAMMQ8TF30 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
WHAMMQ8TF30 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WHAMMQ8TF30 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WHAMMQ8TF30 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WHAMMQ8TF30 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
WHAMMQ8TF30 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WHAMMQ8TF30 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
WHAMMQ8TF30 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
WHAMMQ8TF30 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
WHAMMQ8TF30 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
WHAMMQ8TF30 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
WHAMMQ8TF30 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
WHAMMQ8TF30 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
WHAMMQ8TF30 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
WHAMMQ8TF30 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WHAMMQ8TF30 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
WHAMMQ8TF30 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
WHAMMQ8TF30 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WHAMMQ8TF30 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
WHAMMQ8TF30 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
WHAMMQ8TF30 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
WHAMMQ8TF30 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
WHAMMQ8TF30 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
WHAMMQ8TF30 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WHAMMQ8TF30 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WHAMMQ8TF30 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WHAMMQ8TF30 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
WHAMMQ8TF30 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WHAMMQ8TF30 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
WHAMMQ8TF30 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
WHAMMQ8TF30 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
WHAMMQ8TF30 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
WHAMMQ8TF30 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WHAMMQ8TF30 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WHAMMQ8TF30 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
WHAMMQ8TF30 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WHAMMQ8TF30 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WHAMMQ8TF30 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WHAMMQ8TF30 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WHAMMQ8TF30 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
WHAMMQ8TF30 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
WHAMMQ8TF30 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
WHAMMQ8TF30 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
WHAMMQ8TF30 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
WHAMMQ8TF30 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
WHAMMQ8TF30 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
WHAMMQ8TF30 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
WHAMMQ8TF30 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WHAMMQ8TF30 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WHAMMQ8TF30 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
WHAMMQ8TF30 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WHAMMQ8TF30 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
WHAMMQ8TF30 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WHAMMQ8TF30 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WHAMMQ8TF30 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WHAMMQ8TF30 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WHAMMQ8TF30 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WHAMMQ8TF30 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WHAMMQ8TF30 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
WHAMMQ8TF30 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
WHAMMQ8TF30 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
WHAMMQ8TF30 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
WHAMMQ8TF30 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
WHAMMQ8TF30 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
WHAMMQ8TF30 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WHAMMQ8TF30 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WHAMMQ8TF30 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WHAMMQ8TF30 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WHAMMQ8TF30 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
WHAMMQ8TF30 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
WHAMMQ8TF30 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
WHAMMQ8TF30 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
WHAMMQ8TF30 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
WHAMMQ8TF30 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
WHAMMQ8TF30 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms