Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRSK1Q8TDC3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRSK1Q8TDC3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRSK1Q8TDC3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRSK1Q8TDC3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRSK1Q8TDC3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRSK1Q8TDC3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRSK1Q8TDC3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRSK1Q8TDC3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRSK1Q8TDC3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRSK1Q8TDC3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRSK1Q8TDC3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRSK1Q8TDC3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRSK1Q8TDC3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRSK1Q8TDC3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRSK1Q8TDC3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
BRSK1Q8TDC3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRSK1Q8TDC3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
BRSK1Q8TDC3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRSK1Q8TDC3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRSK1Q8TDC3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRSK1Q8TDC3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRSK1Q8TDC3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRSK1Q8TDC3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRSK1Q8TDC3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRSK1Q8TDC3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRSK1Q8TDC3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRSK1Q8TDC3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRSK1Q8TDC3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRSK1Q8TDC3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRSK1Q8TDC3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRSK1Q8TDC3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRSK1Q8TDC3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRSK1Q8TDC3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRSK1Q8TDC3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRSK1Q8TDC3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRSK1Q8TDC3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRSK1Q8TDC3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRSK1Q8TDC3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRSK1Q8TDC3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRSK1Q8TDC3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRSK1Q8TDC3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRSK1Q8TDC3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRSK1Q8TDC3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRSK1Q8TDC3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRSK1Q8TDC3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRSK1Q8TDC3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
BRSK1Q8TDC3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRSK1Q8TDC3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
BRSK1Q8TDC3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRSK1Q8TDC3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRSK1Q8TDC3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRSK1Q8TDC3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRSK1Q8TDC3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRSK1Q8TDC3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRSK1Q8TDC3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
BRSK1Q8TDC3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.6 ms