Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM71BQ8TC56 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM71BQ8TC56 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM71BQ8TC56 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM71BQ8TC56 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM71BQ8TC56 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM71BQ8TC56 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM71BQ8TC56 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM71BQ8TC56 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM71BQ8TC56 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM71BQ8TC56 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM71BQ8TC56 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM71BQ8TC56 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM71BQ8TC56 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM71BQ8TC56 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM71BQ8TC56 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM71BQ8TC56 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FAM71BQ8TC56 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FAM71BQ8TC56 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM71BQ8TC56 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FAM71BQ8TC56 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FAM71BQ8TC56 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FAM71BQ8TC56 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM71BQ8TC56 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM71BQ8TC56 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM71BQ8TC56 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM71BQ8TC56 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM71BQ8TC56 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM71BQ8TC56 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM71BQ8TC56 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM71BQ8TC56 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM71BQ8TC56 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM71BQ8TC56 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM71BQ8TC56 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM71BQ8TC56 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM71BQ8TC56 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM71BQ8TC56 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM71BQ8TC56 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM71BQ8TC56 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM71BQ8TC56 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM71BQ8TC56 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM71BQ8TC56 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FAM71BQ8TC56 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM71BQ8TC56 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM71BQ8TC56 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM71BQ8TC56 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 832.6 ms