Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB73

NDNF, Protein NDNF, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNFQ8TB73 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDNFQ8TB73 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDNFQ8TB73 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDNFQ8TB73 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDNFQ8TB73 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDNFQ8TB73 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDNFQ8TB73 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDNFQ8TB73 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDNFQ8TB73 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDNFQ8TB73 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDNFQ8TB73 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDNFQ8TB73 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDNFQ8TB73 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDNFQ8TB73 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NDNFQ8TB73 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDNFQ8TB73 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDNFQ8TB73 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDNFQ8TB73 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDNFQ8TB73 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDNFQ8TB73 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NDNFQ8TB73 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDNFQ8TB73 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDNFQ8TB73 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDNFQ8TB73 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDNFQ8TB73 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDNFQ8TB73 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDNFQ8TB73 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDNFQ8TB73 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDNFQ8TB73 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDNFQ8TB73 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDNFQ8TB73 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NDNFQ8TB73 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDNFQ8TB73 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDNFQ8TB73 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDNFQ8TB73 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDNFQ8TB73 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDNFQ8TB73 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDNFQ8TB73 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDNFQ8TB73 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDNFQ8TB73 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDNFQ8TB73 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDNFQ8TB73 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDNFQ8TB73 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDNFQ8TB73 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDNFQ8TB73 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDNFQ8TB73 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDNFQ8TB73 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDNFQ8TB73 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDNFQ8TB73 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDNFQ8TB73 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDNFQ8TB73 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDNFQ8TB73 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDNFQ8TB73 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDNFQ8TB73 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDNFQ8TB73 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDNFQ8TB73 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDNFQ8TB73 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDNFQ8TB73 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDNFQ8TB73 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDNFQ8TB73 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDNFQ8TB73 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDNFQ8TB73 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDNFQ8TB73 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDNFQ8TB73 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDNFQ8TB73 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDNFQ8TB73 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDNFQ8TB73 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDNFQ8TB73 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDNFQ8TB73 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDNFQ8TB73 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDNFQ8TB73 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NDNFQ8TB73 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms