Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV9

RHOXF1, Rhox homeobox family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF1Q8NHV9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOXF1Q8NHV9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOXF1Q8NHV9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOXF1Q8NHV9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHOXF1Q8NHV9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOXF1Q8NHV9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOXF1Q8NHV9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOXF1Q8NHV9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOXF1Q8NHV9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOXF1Q8NHV9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOXF1Q8NHV9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOXF1Q8NHV9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOXF1Q8NHV9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOXF1Q8NHV9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOXF1Q8NHV9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOXF1Q8NHV9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOXF1Q8NHV9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOXF1Q8NHV9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOXF1Q8NHV9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOXF1Q8NHV9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOXF1Q8NHV9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOXF1Q8NHV9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOXF1Q8NHV9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOXF1Q8NHV9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF1Q8NHV9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF1Q8NHV9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF1Q8NHV9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF1Q8NHV9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF1Q8NHV9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF1Q8NHV9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOXF1Q8NHV9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF1Q8NHV9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF1Q8NHV9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOXF1Q8NHV9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOXF1Q8NHV9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOXF1Q8NHV9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOXF1Q8NHV9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOXF1Q8NHV9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOXF1Q8NHV9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOXF1Q8NHV9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOXF1Q8NHV9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF1Q8NHV9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF1Q8NHV9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOXF1Q8NHV9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOXF1Q8NHV9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOXF1Q8NHV9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOXF1Q8NHV9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOXF1Q8NHV9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOXF1Q8NHV9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOXF1Q8NHV9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOXF1Q8NHV9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOXF1Q8NHV9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOXF1Q8NHV9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOXF1Q8NHV9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOXF1Q8NHV9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOXF1Q8NHV9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOXF1Q8NHV9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOXF1Q8NHV9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOXF1Q8NHV9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOXF1Q8NHV9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOXF1Q8NHV9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RHOXF1Q8NHV9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOXF1Q8NHV9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOXF1Q8NHV9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOXF1Q8NHV9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOXF1Q8NHV9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOXF1Q8NHV9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOXF1Q8NHV9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOXF1Q8NHV9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOXF1Q8NHV9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOXF1Q8NHV9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOXF1Q8NHV9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOXF1Q8NHV9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOXF1Q8NHV9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOXF1Q8NHV9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOXF1Q8NHV9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOXF1Q8NHV9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF1Q8NHV9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF1Q8NHV9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF1Q8NHV9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHOXF1Q8NHV9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHOXF1Q8NHV9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOXF1Q8NHV9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOXF1Q8NHV9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF1Q8NHV9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF1Q8NHV9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF1Q8NHV9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF1Q8NHV9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF1Q8NHV9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOXF1Q8NHV9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOXF1Q8NHV9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF1Q8NHV9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF1Q8NHV9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF1Q8NHV9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF1Q8NHV9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF1Q8NHV9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF1Q8NHV9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF1Q8NHV9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOXF1Q8NHV9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF1Q8NHV9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms