Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFA0

USP32, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 32, humanhuman

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP32Q8NFA0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
USP32Q8NFA0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
USP32Q8NFA0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
USP32Q8NFA0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
USP32Q8NFA0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
USP32Q8NFA0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
USP32Q8NFA0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
USP32Q8NFA0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
USP32Q8NFA0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
USP32Q8NFA0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
USP32Q8NFA0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
USP32Q8NFA0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
USP32Q8NFA0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
USP32Q8NFA0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
USP32Q8NFA0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
USP32Q8NFA0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
USP32Q8NFA0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
USP32Q8NFA0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
USP32Q8NFA0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
USP32Q8NFA0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
USP32Q8NFA0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.88■■■■□ 3.49
USP32Q8NFA0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
USP32Q8NFA0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
USP32Q8NFA0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
USP32Q8NFA0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
USP32Q8NFA0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
USP32Q8NFA0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
USP32Q8NFA0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
USP32Q8NFA0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
USP32Q8NFA0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
USP32Q8NFA0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
USP32Q8NFA0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
USP32Q8NFA0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
USP32Q8NFA0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
USP32Q8NFA0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
USP32Q8NFA0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
USP32Q8NFA0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
USP32Q8NFA0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
USP32Q8NFA0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
USP32Q8NFA0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
USP32Q8NFA0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
USP32Q8NFA0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
USP32Q8NFA0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
USP32Q8NFA0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
USP32Q8NFA0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
USP32Q8NFA0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
USP32Q8NFA0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
USP32Q8NFA0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
USP32Q8NFA0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
USP32Q8NFA0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
USP32Q8NFA0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
USP32Q8NFA0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
USP32Q8NFA0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
USP32Q8NFA0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
USP32Q8NFA0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
USP32Q8NFA0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
USP32Q8NFA0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
USP32Q8NFA0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
USP32Q8NFA0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
USP32Q8NFA0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
USP32Q8NFA0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
USP32Q8NFA0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
USP32Q8NFA0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
USP32Q8NFA0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
USP32Q8NFA0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
USP32Q8NFA0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
USP32Q8NFA0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
USP32Q8NFA0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
USP32Q8NFA0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
USP32Q8NFA0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
USP32Q8NFA0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
USP32Q8NFA0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
USP32Q8NFA0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
USP32Q8NFA0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
USP32Q8NFA0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
USP32Q8NFA0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
USP32Q8NFA0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
USP32Q8NFA0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
USP32Q8NFA0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
USP32Q8NFA0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
USP32Q8NFA0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
USP32Q8NFA0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
USP32Q8NFA0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
USP32Q8NFA0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
USP32Q8NFA0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
USP32Q8NFA0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
USP32Q8NFA0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
USP32Q8NFA0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
USP32Q8NFA0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
USP32Q8NFA0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
USP32Q8NFA0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
USP32Q8NFA0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
USP32Q8NFA0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
USP32Q8NFA0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
USP32Q8NFA0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
USP32Q8NFA0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
USP32Q8NFA0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
USP32Q8NFA0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
USP32Q8NFA0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
USP32Q8NFA0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms