Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG4

FAM83F, Protein FAM83F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83FQ8NEG4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM83FQ8NEG4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM83FQ8NEG4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM83FQ8NEG4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM83FQ8NEG4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM83FQ8NEG4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM83FQ8NEG4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM83FQ8NEG4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM83FQ8NEG4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM83FQ8NEG4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM83FQ8NEG4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM83FQ8NEG4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM83FQ8NEG4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM83FQ8NEG4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM83FQ8NEG4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM83FQ8NEG4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM83FQ8NEG4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM83FQ8NEG4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM83FQ8NEG4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM83FQ8NEG4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM83FQ8NEG4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM83FQ8NEG4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM83FQ8NEG4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM83FQ8NEG4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM83FQ8NEG4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM83FQ8NEG4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM83FQ8NEG4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM83FQ8NEG4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM83FQ8NEG4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM83FQ8NEG4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM83FQ8NEG4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM83FQ8NEG4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM83FQ8NEG4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM83FQ8NEG4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM83FQ8NEG4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM83FQ8NEG4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM83FQ8NEG4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM83FQ8NEG4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM83FQ8NEG4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM83FQ8NEG4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM83FQ8NEG4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM83FQ8NEG4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM83FQ8NEG4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM83FQ8NEG4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM83FQ8NEG4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM83FQ8NEG4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM83FQ8NEG4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms