Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3C3Q8NEB9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3C3Q8NEB9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3C3Q8NEB9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3C3Q8NEB9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3C3Q8NEB9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3C3Q8NEB9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3C3Q8NEB9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3C3Q8NEB9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3C3Q8NEB9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3C3Q8NEB9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3C3Q8NEB9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3C3Q8NEB9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3C3Q8NEB9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3C3Q8NEB9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C3Q8NEB9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C3Q8NEB9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3C3Q8NEB9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3C3Q8NEB9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C3Q8NEB9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIK3C3Q8NEB9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3C3Q8NEB9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3C3Q8NEB9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3C3Q8NEB9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3C3Q8NEB9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3C3Q8NEB9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3C3Q8NEB9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3C3Q8NEB9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3C3Q8NEB9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3C3Q8NEB9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3C3Q8NEB9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3C3Q8NEB9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3C3Q8NEB9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3C3Q8NEB9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3C3Q8NEB9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3C3Q8NEB9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3C3Q8NEB9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3C3Q8NEB9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3C3Q8NEB9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3C3Q8NEB9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3C3Q8NEB9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3C3Q8NEB9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3C3Q8NEB9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3C3Q8NEB9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3C3Q8NEB9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3C3Q8NEB9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3C3Q8NEB9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C3Q8NEB9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C3Q8NEB9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3C3Q8NEB9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C3Q8NEB9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C3Q8NEB9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C3Q8NEB9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3C3Q8NEB9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3C3Q8NEB9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3C3Q8NEB9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3C3Q8NEB9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3C3Q8NEB9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3C3Q8NEB9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3C3Q8NEB9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C3Q8NEB9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C3Q8NEB9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C3Q8NEB9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3C3Q8NEB9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C3Q8NEB9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C3Q8NEB9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C3Q8NEB9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3C3Q8NEB9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PIK3C3Q8NEB9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3C3Q8NEB9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3C3Q8NEB9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3C3Q8NEB9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3C3Q8NEB9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3C3Q8NEB9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3C3Q8NEB9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3C3Q8NEB9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3C3Q8NEB9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3C3Q8NEB9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms