Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCY6

MSANTD4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD4Q8NCY6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MSANTD4Q8NCY6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MSANTD4Q8NCY6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MSANTD4Q8NCY6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MSANTD4Q8NCY6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MSANTD4Q8NCY6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSANTD4Q8NCY6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms