Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LINC00116Q8NCU8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LINC00116Q8NCU8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
LINC00116Q8NCU8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LINC00116Q8NCU8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LINC00116Q8NCU8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LINC00116Q8NCU8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LINC00116Q8NCU8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LINC00116Q8NCU8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LINC00116Q8NCU8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LINC00116Q8NCU8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LINC00116Q8NCU8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LINC00116Q8NCU8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LINC00116Q8NCU8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LINC00116Q8NCU8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LINC00116Q8NCU8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LINC00116Q8NCU8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LINC00116Q8NCU8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LINC00116Q8NCU8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LINC00116Q8NCU8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LINC00116Q8NCU8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LINC00116Q8NCU8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LINC00116Q8NCU8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LINC00116Q8NCU8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LINC00116Q8NCU8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LINC00116Q8NCU8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LINC00116Q8NCU8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LINC00116Q8NCU8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LINC00116Q8NCU8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LINC00116Q8NCU8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LINC00116Q8NCU8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LINC00116Q8NCU8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
LINC00116Q8NCU8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LINC00116Q8NCU8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LINC00116Q8NCU8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LINC00116Q8NCU8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LINC00116Q8NCU8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LINC00116Q8NCU8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LINC00116Q8NCU8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LINC00116Q8NCU8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
LINC00116Q8NCU8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
LINC00116Q8NCU8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
LINC00116Q8NCU8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LINC00116Q8NCU8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
LINC00116Q8NCU8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LINC00116Q8NCU8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LINC00116Q8NCU8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LINC00116Q8NCU8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LINC00116Q8NCU8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LINC00116Q8NCU8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LINC00116Q8NCU8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LINC00116Q8NCU8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LINC00116Q8NCU8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LINC00116Q8NCU8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LINC00116Q8NCU8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LINC00116Q8NCU8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LINC00116Q8NCU8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LINC00116Q8NCU8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LINC00116Q8NCU8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LINC00116Q8NCU8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LINC00116Q8NCU8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LINC00116Q8NCU8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
LINC00116Q8NCU8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LINC00116Q8NCU8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LINC00116Q8NCU8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LINC00116Q8NCU8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
LINC00116Q8NCU8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LINC00116Q8NCU8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LINC00116Q8NCU8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LINC00116Q8NCU8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LINC00116Q8NCU8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LINC00116Q8NCU8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LINC00116Q8NCU8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LINC00116Q8NCU8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
LINC00116Q8NCU8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
LINC00116Q8NCU8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LINC00116Q8NCU8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LINC00116Q8NCU8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LINC00116Q8NCU8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LINC00116Q8NCU8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LINC00116Q8NCU8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LINC00116Q8NCU8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LINC00116Q8NCU8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LINC00116Q8NCU8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LINC00116Q8NCU8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LINC00116Q8NCU8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
LINC00116Q8NCU8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
LINC00116Q8NCU8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
LINC00116Q8NCU8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LINC00116Q8NCU8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LINC00116Q8NCU8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
LINC00116Q8NCU8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LINC00116Q8NCU8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LINC00116Q8NCU8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LINC00116Q8NCU8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
LINC00116Q8NCU8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
LINC00116Q8NCU8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
LINC00116Q8NCU8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.78■■■■□ 3
LINC00116Q8NCU8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LINC00116Q8NCU8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms