Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HJURPQ8NCD3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HJURPQ8NCD3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HJURPQ8NCD3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HJURPQ8NCD3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HJURPQ8NCD3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HJURPQ8NCD3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HJURPQ8NCD3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HJURPQ8NCD3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HJURPQ8NCD3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HJURPQ8NCD3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HJURPQ8NCD3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HJURPQ8NCD3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HJURPQ8NCD3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HJURPQ8NCD3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HJURPQ8NCD3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HJURPQ8NCD3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HJURPQ8NCD3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HJURPQ8NCD3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HJURPQ8NCD3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HJURPQ8NCD3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HJURPQ8NCD3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HJURPQ8NCD3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HJURPQ8NCD3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HJURPQ8NCD3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HJURPQ8NCD3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HJURPQ8NCD3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HJURPQ8NCD3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HJURPQ8NCD3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HJURPQ8NCD3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HJURPQ8NCD3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HJURPQ8NCD3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HJURPQ8NCD3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HJURPQ8NCD3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
HJURPQ8NCD3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HJURPQ8NCD3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HJURPQ8NCD3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HJURPQ8NCD3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HJURPQ8NCD3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HJURPQ8NCD3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HJURPQ8NCD3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HJURPQ8NCD3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HJURPQ8NCD3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HJURPQ8NCD3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HJURPQ8NCD3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HJURPQ8NCD3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HJURPQ8NCD3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HJURPQ8NCD3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HJURPQ8NCD3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HJURPQ8NCD3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HJURPQ8NCD3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HJURPQ8NCD3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HJURPQ8NCD3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HJURPQ8NCD3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HJURPQ8NCD3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HJURPQ8NCD3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HJURPQ8NCD3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HJURPQ8NCD3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HJURPQ8NCD3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HJURPQ8NCD3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HJURPQ8NCD3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HJURPQ8NCD3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HJURPQ8NCD3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HJURPQ8NCD3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HJURPQ8NCD3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HJURPQ8NCD3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HJURPQ8NCD3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HJURPQ8NCD3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HJURPQ8NCD3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HJURPQ8NCD3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HJURPQ8NCD3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HJURPQ8NCD3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HJURPQ8NCD3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HJURPQ8NCD3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HJURPQ8NCD3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HJURPQ8NCD3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HJURPQ8NCD3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HJURPQ8NCD3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HJURPQ8NCD3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HJURPQ8NCD3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HJURPQ8NCD3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HJURPQ8NCD3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HJURPQ8NCD3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HJURPQ8NCD3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HJURPQ8NCD3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HJURPQ8NCD3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HJURPQ8NCD3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HJURPQ8NCD3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HJURPQ8NCD3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HJURPQ8NCD3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HJURPQ8NCD3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HJURPQ8NCD3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HJURPQ8NCD3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HJURPQ8NCD3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HJURPQ8NCD3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HJURPQ8NCD3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HJURPQ8NCD3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HJURPQ8NCD3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HJURPQ8NCD3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HJURPQ8NCD3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms