Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNLDC1Q8NA58 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PNLDC1Q8NA58 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNLDC1Q8NA58 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNLDC1Q8NA58 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNLDC1Q8NA58 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNLDC1Q8NA58 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNLDC1Q8NA58 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNLDC1Q8NA58 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNLDC1Q8NA58 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNLDC1Q8NA58 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNLDC1Q8NA58 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNLDC1Q8NA58 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNLDC1Q8NA58 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNLDC1Q8NA58 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNLDC1Q8NA58 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNLDC1Q8NA58 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNLDC1Q8NA58 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNLDC1Q8NA58 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNLDC1Q8NA58 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNLDC1Q8NA58 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNLDC1Q8NA58 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNLDC1Q8NA58 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNLDC1Q8NA58 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNLDC1Q8NA58 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNLDC1Q8NA58 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNLDC1Q8NA58 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNLDC1Q8NA58 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNLDC1Q8NA58 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNLDC1Q8NA58 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNLDC1Q8NA58 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNLDC1Q8NA58 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNLDC1Q8NA58 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNLDC1Q8NA58 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNLDC1Q8NA58 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PNLDC1Q8NA58 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNLDC1Q8NA58 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNLDC1Q8NA58 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PNLDC1Q8NA58 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PNLDC1Q8NA58 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNLDC1Q8NA58 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNLDC1Q8NA58 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNLDC1Q8NA58 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNLDC1Q8NA58 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PNLDC1Q8NA58 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNLDC1Q8NA58 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNLDC1Q8NA58 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNLDC1Q8NA58 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNLDC1Q8NA58 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNLDC1Q8NA58 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNLDC1Q8NA58 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNLDC1Q8NA58 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNLDC1Q8NA58 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms