Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MFSD2AQ8NA29 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MFSD2AQ8NA29 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MFSD2AQ8NA29 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MFSD2AQ8NA29 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MFSD2AQ8NA29 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MFSD2AQ8NA29 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MFSD2AQ8NA29 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MFSD2AQ8NA29 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MFSD2AQ8NA29 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MFSD2AQ8NA29 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MFSD2AQ8NA29 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MFSD2AQ8NA29 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MFSD2AQ8NA29 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MFSD2AQ8NA29 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MFSD2AQ8NA29 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MFSD2AQ8NA29 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MFSD2AQ8NA29 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MFSD2AQ8NA29 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MFSD2AQ8NA29 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MFSD2AQ8NA29 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MFSD2AQ8NA29 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MFSD2AQ8NA29 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MFSD2AQ8NA29 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MFSD2AQ8NA29 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MFSD2AQ8NA29 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MFSD2AQ8NA29 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MFSD2AQ8NA29 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MFSD2AQ8NA29 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MFSD2AQ8NA29 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MFSD2AQ8NA29 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MFSD2AQ8NA29 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MFSD2AQ8NA29 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MFSD2AQ8NA29 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MFSD2AQ8NA29 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MFSD2AQ8NA29 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MFSD2AQ8NA29 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MFSD2AQ8NA29 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MFSD2AQ8NA29 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MFSD2AQ8NA29 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MFSD2AQ8NA29 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MFSD2AQ8NA29 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MFSD2AQ8NA29 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MFSD2AQ8NA29 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MFSD2AQ8NA29 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MFSD2AQ8NA29 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MFSD2AQ8NA29 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MFSD2AQ8NA29 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MFSD2AQ8NA29 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MFSD2AQ8NA29 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MFSD2AQ8NA29 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MFSD2AQ8NA29 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MFSD2AQ8NA29 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MFSD2AQ8NA29 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MFSD2AQ8NA29 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MFSD2AQ8NA29 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MFSD2AQ8NA29 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MFSD2AQ8NA29 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MFSD2AQ8NA29 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MFSD2AQ8NA29 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MFSD2AQ8NA29 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MFSD2AQ8NA29 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MFSD2AQ8NA29 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MFSD2AQ8NA29 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MFSD2AQ8NA29 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MFSD2AQ8NA29 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MFSD2AQ8NA29 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MFSD2AQ8NA29 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MFSD2AQ8NA29 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MFSD2AQ8NA29 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MFSD2AQ8NA29 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MFSD2AQ8NA29 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MFSD2AQ8NA29 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MFSD2AQ8NA29 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MFSD2AQ8NA29 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MFSD2AQ8NA29 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MFSD2AQ8NA29 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MFSD2AQ8NA29 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms