Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8F6

YIPF7, Protein YIPF7, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF7Q8N8F6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIPF7Q8N8F6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIPF7Q8N8F6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIPF7Q8N8F6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF7Q8N8F6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF7Q8N8F6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YIPF7Q8N8F6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YIPF7Q8N8F6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YIPF7Q8N8F6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YIPF7Q8N8F6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
YIPF7Q8N8F6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YIPF7Q8N8F6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YIPF7Q8N8F6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
YIPF7Q8N8F6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
YIPF7Q8N8F6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YIPF7Q8N8F6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YIPF7Q8N8F6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YIPF7Q8N8F6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YIPF7Q8N8F6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YIPF7Q8N8F6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YIPF7Q8N8F6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YIPF7Q8N8F6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YIPF7Q8N8F6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YIPF7Q8N8F6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YIPF7Q8N8F6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YIPF7Q8N8F6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YIPF7Q8N8F6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YIPF7Q8N8F6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YIPF7Q8N8F6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YIPF7Q8N8F6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YIPF7Q8N8F6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YIPF7Q8N8F6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YIPF7Q8N8F6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YIPF7Q8N8F6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YIPF7Q8N8F6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YIPF7Q8N8F6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YIPF7Q8N8F6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YIPF7Q8N8F6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YIPF7Q8N8F6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YIPF7Q8N8F6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YIPF7Q8N8F6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YIPF7Q8N8F6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YIPF7Q8N8F6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YIPF7Q8N8F6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YIPF7Q8N8F6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YIPF7Q8N8F6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YIPF7Q8N8F6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YIPF7Q8N8F6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YIPF7Q8N8F6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YIPF7Q8N8F6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YIPF7Q8N8F6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
YIPF7Q8N8F6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YIPF7Q8N8F6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
YIPF7Q8N8F6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YIPF7Q8N8F6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YIPF7Q8N8F6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YIPF7Q8N8F6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YIPF7Q8N8F6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YIPF7Q8N8F6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
YIPF7Q8N8F6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YIPF7Q8N8F6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YIPF7Q8N8F6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YIPF7Q8N8F6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YIPF7Q8N8F6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YIPF7Q8N8F6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
YIPF7Q8N8F6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YIPF7Q8N8F6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YIPF7Q8N8F6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YIPF7Q8N8F6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YIPF7Q8N8F6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YIPF7Q8N8F6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YIPF7Q8N8F6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YIPF7Q8N8F6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YIPF7Q8N8F6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YIPF7Q8N8F6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YIPF7Q8N8F6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YIPF7Q8N8F6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YIPF7Q8N8F6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YIPF7Q8N8F6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YIPF7Q8N8F6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YIPF7Q8N8F6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YIPF7Q8N8F6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YIPF7Q8N8F6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YIPF7Q8N8F6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YIPF7Q8N8F6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YIPF7Q8N8F6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YIPF7Q8N8F6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YIPF7Q8N8F6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YIPF7Q8N8F6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YIPF7Q8N8F6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YIPF7Q8N8F6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
YIPF7Q8N8F6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YIPF7Q8N8F6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YIPF7Q8N8F6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YIPF7Q8N8F6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YIPF7Q8N8F6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YIPF7Q8N8F6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YIPF7Q8N8F6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YIPF7Q8N8F6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YIPF7Q8N8F6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms