Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7R0

NANOGP1, Putative homeobox protein NANOG2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP1Q8N7R0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NANOGP1Q8N7R0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NANOGP1Q8N7R0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NANOGP1Q8N7R0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGP1Q8N7R0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGP1Q8N7R0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGP1Q8N7R0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGP1Q8N7R0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NANOGP1Q8N7R0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NANOGP1Q8N7R0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NANOGP1Q8N7R0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NANOGP1Q8N7R0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NANOGP1Q8N7R0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NANOGP1Q8N7R0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NANOGP1Q8N7R0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NANOGP1Q8N7R0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NANOGP1Q8N7R0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NANOGP1Q8N7R0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NANOGP1Q8N7R0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NANOGP1Q8N7R0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NANOGP1Q8N7R0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NANOGP1Q8N7R0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NANOGP1Q8N7R0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NANOGP1Q8N7R0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NANOGP1Q8N7R0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NANOGP1Q8N7R0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NANOGP1Q8N7R0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NANOGP1Q8N7R0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NANOGP1Q8N7R0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NANOGP1Q8N7R0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NANOGP1Q8N7R0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NANOGP1Q8N7R0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NANOGP1Q8N7R0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NANOGP1Q8N7R0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NANOGP1Q8N7R0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NANOGP1Q8N7R0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NANOGP1Q8N7R0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NANOGP1Q8N7R0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NANOGP1Q8N7R0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NANOGP1Q8N7R0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NANOGP1Q8N7R0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NANOGP1Q8N7R0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NANOGP1Q8N7R0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NANOGP1Q8N7R0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NANOGP1Q8N7R0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NANOGP1Q8N7R0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NANOGP1Q8N7R0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NANOGP1Q8N7R0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NANOGP1Q8N7R0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NANOGP1Q8N7R0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NANOGP1Q8N7R0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NANOGP1Q8N7R0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NANOGP1Q8N7R0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NANOGP1Q8N7R0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NANOGP1Q8N7R0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NANOGP1Q8N7R0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NANOGP1Q8N7R0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NANOGP1Q8N7R0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NANOGP1Q8N7R0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NANOGP1Q8N7R0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NANOGP1Q8N7R0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NANOGP1Q8N7R0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NANOGP1Q8N7R0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NANOGP1Q8N7R0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NANOGP1Q8N7R0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NANOGP1Q8N7R0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NANOGP1Q8N7R0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NANOGP1Q8N7R0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NANOGP1Q8N7R0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NANOGP1Q8N7R0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NANOGP1Q8N7R0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NANOGP1Q8N7R0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NANOGP1Q8N7R0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NANOGP1Q8N7R0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NANOGP1Q8N7R0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NANOGP1Q8N7R0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NANOGP1Q8N7R0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms