Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF148Q8N7C7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF148Q8N7C7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF148Q8N7C7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF148Q8N7C7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF148Q8N7C7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF148Q8N7C7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF148Q8N7C7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF148Q8N7C7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF148Q8N7C7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF148Q8N7C7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF148Q8N7C7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF148Q8N7C7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF148Q8N7C7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF148Q8N7C7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF148Q8N7C7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF148Q8N7C7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF148Q8N7C7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF148Q8N7C7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF148Q8N7C7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF148Q8N7C7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF148Q8N7C7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF148Q8N7C7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF148Q8N7C7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF148Q8N7C7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF148Q8N7C7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF148Q8N7C7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF148Q8N7C7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF148Q8N7C7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF148Q8N7C7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF148Q8N7C7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF148Q8N7C7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF148Q8N7C7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF148Q8N7C7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF148Q8N7C7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF148Q8N7C7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF148Q8N7C7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF148Q8N7C7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF148Q8N7C7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RNF148Q8N7C7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF148Q8N7C7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF148Q8N7C7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF148Q8N7C7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF148Q8N7C7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF148Q8N7C7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF148Q8N7C7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF148Q8N7C7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF148Q8N7C7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF148Q8N7C7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF148Q8N7C7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF148Q8N7C7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF148Q8N7C7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF148Q8N7C7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF148Q8N7C7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF148Q8N7C7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF148Q8N7C7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF148Q8N7C7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF148Q8N7C7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF148Q8N7C7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF148Q8N7C7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF148Q8N7C7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF148Q8N7C7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF148Q8N7C7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF148Q8N7C7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF148Q8N7C7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF148Q8N7C7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF148Q8N7C7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF148Q8N7C7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF148Q8N7C7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF148Q8N7C7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF148Q8N7C7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF148Q8N7C7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF148Q8N7C7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF148Q8N7C7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF148Q8N7C7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF148Q8N7C7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF148Q8N7C7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF148Q8N7C7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF148Q8N7C7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF148Q8N7C7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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