Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC17Q8N6Y2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC17Q8N6Y2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC17Q8N6Y2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC17Q8N6Y2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC17Q8N6Y2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC17Q8N6Y2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC17Q8N6Y2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC17Q8N6Y2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC17Q8N6Y2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC17Q8N6Y2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC17Q8N6Y2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC17Q8N6Y2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC17Q8N6Y2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC17Q8N6Y2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC17Q8N6Y2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC17Q8N6Y2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC17Q8N6Y2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRC17Q8N6Y2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC17Q8N6Y2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC17Q8N6Y2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC17Q8N6Y2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC17Q8N6Y2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC17Q8N6Y2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC17Q8N6Y2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC17Q8N6Y2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC17Q8N6Y2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC17Q8N6Y2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC17Q8N6Y2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC17Q8N6Y2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC17Q8N6Y2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC17Q8N6Y2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC17Q8N6Y2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC17Q8N6Y2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC17Q8N6Y2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC17Q8N6Y2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC17Q8N6Y2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC17Q8N6Y2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC17Q8N6Y2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC17Q8N6Y2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC17Q8N6Y2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC17Q8N6Y2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC17Q8N6Y2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC17Q8N6Y2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC17Q8N6Y2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC17Q8N6Y2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC17Q8N6Y2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC17Q8N6Y2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC17Q8N6Y2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC17Q8N6Y2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC17Q8N6Y2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC17Q8N6Y2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC17Q8N6Y2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC17Q8N6Y2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC17Q8N6Y2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC17Q8N6Y2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC17Q8N6Y2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC17Q8N6Y2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC17Q8N6Y2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC17Q8N6Y2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC17Q8N6Y2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC17Q8N6Y2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC17Q8N6Y2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC17Q8N6Y2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC17Q8N6Y2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC17Q8N6Y2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC17Q8N6Y2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC17Q8N6Y2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC17Q8N6Y2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC17Q8N6Y2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC17Q8N6Y2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC17Q8N6Y2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC17Q8N6Y2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC17Q8N6Y2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC17Q8N6Y2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC17Q8N6Y2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC17Q8N6Y2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC17Q8N6Y2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC17Q8N6Y2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC17Q8N6Y2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC17Q8N6Y2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC17Q8N6Y2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC17Q8N6Y2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC17Q8N6Y2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC17Q8N6Y2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC17Q8N6Y2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC17Q8N6Y2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC17Q8N6Y2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC17Q8N6Y2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC17Q8N6Y2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC17Q8N6Y2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC17Q8N6Y2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC17Q8N6Y2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC17Q8N6Y2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC17Q8N6Y2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC17Q8N6Y2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms