Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M0

OTUD6B, OTU domain-containing protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6BQ8N6M0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
OTUD6BQ8N6M0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
OTUD6BQ8N6M0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OTUD6BQ8N6M0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OTUD6BQ8N6M0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
OTUD6BQ8N6M0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
OTUD6BQ8N6M0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
OTUD6BQ8N6M0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
OTUD6BQ8N6M0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
OTUD6BQ8N6M0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
OTUD6BQ8N6M0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
OTUD6BQ8N6M0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
OTUD6BQ8N6M0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
OTUD6BQ8N6M0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
OTUD6BQ8N6M0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTUD6BQ8N6M0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTUD6BQ8N6M0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTUD6BQ8N6M0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTUD6BQ8N6M0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
OTUD6BQ8N6M0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTUD6BQ8N6M0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTUD6BQ8N6M0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTUD6BQ8N6M0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTUD6BQ8N6M0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
OTUD6BQ8N6M0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
OTUD6BQ8N6M0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
OTUD6BQ8N6M0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
OTUD6BQ8N6M0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
OTUD6BQ8N6M0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
OTUD6BQ8N6M0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
OTUD6BQ8N6M0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTUD6BQ8N6M0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTUD6BQ8N6M0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
OTUD6BQ8N6M0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
OTUD6BQ8N6M0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTUD6BQ8N6M0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTUD6BQ8N6M0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTUD6BQ8N6M0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
OTUD6BQ8N6M0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
OTUD6BQ8N6M0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
OTUD6BQ8N6M0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
OTUD6BQ8N6M0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
OTUD6BQ8N6M0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTUD6BQ8N6M0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTUD6BQ8N6M0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTUD6BQ8N6M0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTUD6BQ8N6M0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTUD6BQ8N6M0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTUD6BQ8N6M0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTUD6BQ8N6M0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTUD6BQ8N6M0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTUD6BQ8N6M0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTUD6BQ8N6M0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTUD6BQ8N6M0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTUD6BQ8N6M0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTUD6BQ8N6M0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTUD6BQ8N6M0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTUD6BQ8N6M0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTUD6BQ8N6M0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTUD6BQ8N6M0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
OTUD6BQ8N6M0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
OTUD6BQ8N6M0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
OTUD6BQ8N6M0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTUD6BQ8N6M0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTUD6BQ8N6M0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTUD6BQ8N6M0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTUD6BQ8N6M0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTUD6BQ8N6M0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTUD6BQ8N6M0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTUD6BQ8N6M0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTUD6BQ8N6M0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTUD6BQ8N6M0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTUD6BQ8N6M0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTUD6BQ8N6M0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTUD6BQ8N6M0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTUD6BQ8N6M0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTUD6BQ8N6M0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTUD6BQ8N6M0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTUD6BQ8N6M0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
OTUD6BQ8N6M0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
OTUD6BQ8N6M0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
OTUD6BQ8N6M0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
OTUD6BQ8N6M0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTUD6BQ8N6M0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTUD6BQ8N6M0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTUD6BQ8N6M0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTUD6BQ8N6M0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTUD6BQ8N6M0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTUD6BQ8N6M0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTUD6BQ8N6M0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTUD6BQ8N6M0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTUD6BQ8N6M0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTUD6BQ8N6M0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTUD6BQ8N6M0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTUD6BQ8N6M0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTUD6BQ8N6M0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTUD6BQ8N6M0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTUD6BQ8N6M0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTUD6BQ8N6M0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTUD6BQ8N6M0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms