Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4A0

GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT4Q8N4A0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GALNT4Q8N4A0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GALNT4Q8N4A0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GALNT4Q8N4A0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GALNT4Q8N4A0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GALNT4Q8N4A0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GALNT4Q8N4A0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GALNT4Q8N4A0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GALNT4Q8N4A0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GALNT4Q8N4A0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GALNT4Q8N4A0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GALNT4Q8N4A0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GALNT4Q8N4A0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GALNT4Q8N4A0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GALNT4Q8N4A0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GALNT4Q8N4A0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GALNT4Q8N4A0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GALNT4Q8N4A0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GALNT4Q8N4A0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GALNT4Q8N4A0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GALNT4Q8N4A0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GALNT4Q8N4A0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GALNT4Q8N4A0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GALNT4Q8N4A0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GALNT4Q8N4A0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GALNT4Q8N4A0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GALNT4Q8N4A0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GALNT4Q8N4A0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GALNT4Q8N4A0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GALNT4Q8N4A0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GALNT4Q8N4A0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GALNT4Q8N4A0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GALNT4Q8N4A0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GALNT4Q8N4A0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GALNT4Q8N4A0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GALNT4Q8N4A0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GALNT4Q8N4A0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GALNT4Q8N4A0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GALNT4Q8N4A0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GALNT4Q8N4A0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GALNT4Q8N4A0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GALNT4Q8N4A0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GALNT4Q8N4A0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GALNT4Q8N4A0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GALNT4Q8N4A0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GALNT4Q8N4A0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GALNT4Q8N4A0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GALNT4Q8N4A0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GALNT4Q8N4A0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GALNT4Q8N4A0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GALNT4Q8N4A0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GALNT4Q8N4A0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GALNT4Q8N4A0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GALNT4Q8N4A0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GALNT4Q8N4A0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GALNT4Q8N4A0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GALNT4Q8N4A0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GALNT4Q8N4A0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GALNT4Q8N4A0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GALNT4Q8N4A0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GALNT4Q8N4A0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GALNT4Q8N4A0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GALNT4Q8N4A0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GALNT4Q8N4A0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GALNT4Q8N4A0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GALNT4Q8N4A0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GALNT4Q8N4A0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GALNT4Q8N4A0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GALNT4Q8N4A0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GALNT4Q8N4A0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GALNT4Q8N4A0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GALNT4Q8N4A0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GALNT4Q8N4A0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GALNT4Q8N4A0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GALNT4Q8N4A0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GALNT4Q8N4A0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GALNT4Q8N4A0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GALNT4Q8N4A0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms