Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SFRP1Q8N474 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SFRP1Q8N474 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SFRP1Q8N474 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms