Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C17orf53Q8N3J3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C17orf53Q8N3J3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C17orf53Q8N3J3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
C17orf53Q8N3J3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C17orf53Q8N3J3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
C17orf53Q8N3J3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C17orf53Q8N3J3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C17orf53Q8N3J3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C17orf53Q8N3J3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C17orf53Q8N3J3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C17orf53Q8N3J3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C17orf53Q8N3J3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
C17orf53Q8N3J3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
C17orf53Q8N3J3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C17orf53Q8N3J3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
C17orf53Q8N3J3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C17orf53Q8N3J3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C17orf53Q8N3J3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C17orf53Q8N3J3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
C17orf53Q8N3J3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C17orf53Q8N3J3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C17orf53Q8N3J3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C17orf53Q8N3J3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C17orf53Q8N3J3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C17orf53Q8N3J3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C17orf53Q8N3J3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
C17orf53Q8N3J3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C17orf53Q8N3J3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
C17orf53Q8N3J3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C17orf53Q8N3J3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C17orf53Q8N3J3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
C17orf53Q8N3J3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
C17orf53Q8N3J3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
C17orf53Q8N3J3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C17orf53Q8N3J3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
C17orf53Q8N3J3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C17orf53Q8N3J3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C17orf53Q8N3J3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C17orf53Q8N3J3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C17orf53Q8N3J3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C17orf53Q8N3J3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C17orf53Q8N3J3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C17orf53Q8N3J3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
C17orf53Q8N3J3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C17orf53Q8N3J3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C17orf53Q8N3J3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C17orf53Q8N3J3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C17orf53Q8N3J3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C17orf53Q8N3J3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C17orf53Q8N3J3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C17orf53Q8N3J3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C17orf53Q8N3J3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C17orf53Q8N3J3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C17orf53Q8N3J3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C17orf53Q8N3J3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C17orf53Q8N3J3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C17orf53Q8N3J3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
C17orf53Q8N3J3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C17orf53Q8N3J3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C17orf53Q8N3J3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C17orf53Q8N3J3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C17orf53Q8N3J3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C17orf53Q8N3J3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C17orf53Q8N3J3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C17orf53Q8N3J3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C17orf53Q8N3J3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C17orf53Q8N3J3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C17orf53Q8N3J3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C17orf53Q8N3J3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C17orf53Q8N3J3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C17orf53Q8N3J3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
C17orf53Q8N3J3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C17orf53Q8N3J3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C17orf53Q8N3J3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C17orf53Q8N3J3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C17orf53Q8N3J3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C17orf53Q8N3J3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C17orf53Q8N3J3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C17orf53Q8N3J3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C17orf53Q8N3J3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C17orf53Q8N3J3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C17orf53Q8N3J3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C17orf53Q8N3J3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C17orf53Q8N3J3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C17orf53Q8N3J3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C17orf53Q8N3J3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C17orf53Q8N3J3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C17orf53Q8N3J3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C17orf53Q8N3J3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C17orf53Q8N3J3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C17orf53Q8N3J3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C17orf53Q8N3J3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C17orf53Q8N3J3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C17orf53Q8N3J3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C17orf53Q8N3J3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C17orf53Q8N3J3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C17orf53Q8N3J3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C17orf53Q8N3J3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C17orf53Q8N3J3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms